儿童脊髓性肌萎缩症2型患者血浆中环状RNA的表达谱分析OA
Analysis in expression profiles of circular RNA in plasma in children with pediatric type 2 spinal muscular atrophy
目的 分析儿童脊髓性肌萎缩症(SMA)2型患者血浆中环状RNA(circRNA)的表达谱变化.方法 选取2021年9月—2022年3月安徽省儿童医院神经内科住院治疗的儿童SMA2型患者5例为SMA组,同期健康对照者5例为对照组.采用高通量测序技术检测并筛选出血浆中差异表达的circRNA,应用生物信息学进行基因本体论(GO)注释、京都基因和基因组百科全书(KEGG)和Reactome通路富集分析.利用在线数据库预测circRNA可能靶向的微小RNA(miRNA).结果 与对照组相比,SMA组患者血浆中共有136个circRNA呈显著差异性表达(P＜0.05,差异倍数≥1.5),包括55个表达上调和81个表达下调的circRNA.生物信息学分析发现,同源重组修复、DNA复制等通路在SMA的发生发展中具有重要作用.应用TargetScan和miRanda软件预测了差异表达circRNA与miRNA的关系,绘制了 circRNA-miRNA调控网络图.结论 SMA组与对照组存在差异表达的circRNA.这些circRNA可能参与SMA的发生、发展,或可成为SMA的新型诊断和治疗的潜在分子标志物.
胡学会;闫红;吴计划;赵忠礼;汪晓翠;杨斌
安徽省儿童医院神经内科,安徽合肥,230000中国科学技术大学第一附属医院临床病理中心,安徽合肥,230001
医药卫生
环状RNA脊髓性肌萎缩症儿童微小RNA高通量测序差异表达谱
《实用临床医药杂志》 2023 (002)
环状RNA-0000284介导miR-326调控FGF1在乳腺癌侵袭转移中的作用及分子机制
22-27,34 / 7
国家自然科学基金(81702594);安徽医科大学校科研基金(2020xkj075)
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