甜瓜LBD基因家族的鉴定和果实发育进程中的表达分析OACSTPCD
Identification and Analysis of LBD Gene Family and Expression Analysis of Fruit Development in Cucumis melo
侧生器官边界域(lateral organ boundaries domain,LBD)基因广泛存在于高等植物中,可以参与调控植物生长发育及逆境响应.通过对甜瓜LBD转录因子的鉴定分析,旨在揭示其在果实发育进程中的调控作用.通过生物信息学分析明确LBD转录因子在基因组中的成员,分别命名为CmLBD1-CmLBD32;采用多序列比对分析甜瓜LBD 结构域的结构特征;运用邻接法、极大似然法进行系统进化树分析;以薄皮甜瓜发育各个阶段的果实(花后 5-40 d,每间隔 5 d取一次样)为试验材料提取RNA,并通过实时荧光定量技术检测LBD成员的基因表达水平.在甜瓜基因组上共鉴定出 32 个甜瓜LBD家族成员,分为 7 大类,分布于12 条染色体上;多序列比对分析表明,32 个LBD基因均具有典型的LOB结构域.在果实发育进程中,LBD家族基因在不同时期均有表达,其中CmLBD2 和CmLBD28 随着果实发育进程表达水平逐渐升高,其余家族成员在果实中表达水平相对较低.亚细胞定位表明,CmLBD2 蛋白定位于细胞膜上.CmLBD2 基因表达量与果实硬度间相关性分析表明,CmLBD2在果实成熟进程中基因表达量与硬度的变化显著负相关;利用外源 1-MCP进行果实处理发现,1-MCP可以抑制CmLBD2基因表达,表明CmLBD2基因表达可能受到乙烯的调控.综上,甜瓜LBD基因在果实发育进程中可能发挥不同的作用,其中CmLBD2 可能参与乙烯调控相关的果实后熟软化.
陈强;邹明康;宋家敏;张冲;吴隆坤
沈阳师范大学生命科学学院,沈阳 110000沈阳师范大学实验教学中心,沈阳 110000沈阳师范大学生命科学学院,沈阳 110000沈阳师范大学生命科学学院,沈阳 110000沈阳师范大学生命科学学院,沈阳 110000
甜瓜LBD转录调控1-MCP基因表达果实发育生物信息学
《生物技术通报》 2023 (3)
176-183,8
辽宁省教育厅项目(LJKMZ20221467),辽宁省博士启动计划项目(BS-213),辽宁省大学生创新创业训练项目(S202110166011),沈阳师范大学博士科研启动基金(BS202106)
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