藏鸡GPX3基因的克隆、组织表达谱研究及功能预测OACSTPCD
Cloning,Tissue Expression Profile and Function Prediction of GPX3 Gene in Tibetan Chicken
本研究对藏鸡GPX3 基因进行克隆和生物信息学分析,检测其在藏鸡不同组织中的表达量,鉴定GPX3 互作蛋白的mRNA表达水平并分析其相关性,为进一步探究GPX3 基因对藏鸡免疫功能的影响奠定基础.本试验以 70 日龄健康藏鸡(公鸡)作为研究对象,利用RT-PCR技术获得GPX3 基因CDS序列并进行生物信息学分析;利用qPCR技术检测GPX3基因在藏鸡心、肝、脾、肺和肾组织中的表达差异情况以及分析可能与GPX3 蛋白存在互作关系的 10 个相关蛋白在脾中的mRNA表达情况及其相关性.结果显示,成功扩增藏鸡GPX3 基因 799 bp,包括 5'UTR 78 bp,CDS区 660 bp,3'UTR 61 bp,可编码 219 个氨基酸.GPX3 mRNA在藏鸡5个组织中均有表达,且在脾中表达量最高,预测GPX3基因在脾中表达量最高这一结果可能与该蛋白的免疫功能有关.GPX3 蛋白与预测互作蛋白SOD2 呈极显著正相关,推测GPX3 在耐药性、生殖调控等方面存在一定的调节作用.本研究成功克隆藏鸡GPX3基因CDS区 660 bp,预测其可能与SOD2 呈极显著正相关.为进一步了解GPX3基因的抗氧化功能在藏鸡免疫机制中的作用提供理论依据.
陈楚雯;李洁;赵瑞鹏;刘媛;吴锦波;李志雄
西南民族大学 青藏高原动物遗传资源保护与利用教育部重点实验室,成都 610041西南民族大学畜牧兽医学院,成都 610041西南民族大学 青藏高原动物遗传资源保护与利用教育部重点实验室,成都 610041西南民族大学畜牧兽医学院,成都 610041西南民族大学 青藏高原动物遗传资源保护与利用教育部重点实验室,成都 610041西南民族大学 青藏高原动物遗传资源保护与利用教育部重点实验室,成都 610041
藏鸡GPX3克隆组织表达谱功能预测
《生物技术通报》 2023 (3)
311-320,10
四川省科技计划项目(2021YFYZ0031),西南民族大学中央高校基本科研业务费专项资金项目(2021PTJS20)
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