荔枝分枝调控基因LcSMXL7的鉴定及功能分析OACSTPCD
Identification and Functional Analysis of Litchi Branching Regulator LcSMXL7
荔枝是华南地区最具特色的水果之一,目前我国荔枝栽培面积约 53 万 hm2,产量 230 万 t.荔枝花序呈聚伞花序圆锥状排列,分枝数量过多会消耗树体大量营养,影响荔枝坐果.SUPPRESSOR OF MAX21-LIKE 7(SMXL7)是独脚金内酯信号途径的重要组分,是具有抑制子和转录因子双重功能的新型抑制子,参与调控植物的分枝发育.为了鉴定荔枝花穗分枝发育的调控基因,本研究以'妃子笑/怀枝'砧穗组合荔枝结果树花穗为试材,利用RNA-seq数据克隆荔枝SMXL7基因家族成员LcSMXL7,并对其基因序列、理化性质、保守结构域、进化关系、组织表达特异性,基因功能及亚细胞定位进行分析.分析结果显示,该基因ORF全长 3408 bp,编码 1135 个氨基酸;编码蛋白含有 2 个Clp结构域和 1 个AAA_2 结构域;在茎、种子和叶片中表达较高,在花穗、雄花和果皮中表达次之,而在雌花、果肉和根中的表达最低;LcSMXL7 的分子式为C5429H8632N1530O1715S38,理论相对分子质量(Mw)为 123.99 kDa,理论等电点(pI)约为 5.96,蛋白脂溶指数为 83.74,蛋白不稳定指数为 46.38,亲水性平均系数为-0.305,与来自木本果树甜橙和杧果的SMXL7 蛋白的关系较近,亚细胞定位在细胞核;在拟南芥中过表达LcSMXL7可显著提高拟南芥的分枝数量.推测LcSMXL7 可作为转录因子参与基因表达调控,该研究为进一步探索LcSMXL7调控荔枝花穗发育的分子机制奠定了基础.
王弋;付灯恩;董晨;郑雪文;李伟才
中国热带农业科学院南亚热带作物研究所/农业农村部热带果树生物学重点实验室,广东湛江 524091云南农业大学热带作物学院,云南普洱 665099中国热带农业科学院南亚热带作物研究所/农业农村部热带果树生物学重点实验室,广东湛江 524091中国热带农业科学院南亚热带作物研究所/农业农村部热带果树生物学重点实验室,广东湛江 524091中国热带农业科学院南亚热带作物研究所/农业农村部热带果树生物学重点实验室,广东湛江 524091
农业科技
荔枝LcSMXL7分枝独脚金内酯生物信息学
《热带作物学报》 2023 (3)
447-452,6
海南省自然科学基金青年基金项目(No.320QN321)广东省自然科学基金-青年提升项目(No.2023A1515030266)中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(No.1630042022004).
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