低起始量的免疫共沉淀技术研究进展OACSTPCD

将染色质免疫共沉淀技术(chromatin immunoprecipitation assay,ChIP)和第二代测序技术相结合的染色体免疫共沉淀测序技术(co-immunoprecitation followed by sequencing,ChIP-seq)是分析全基因组表观遗传学变化的重要方法,它可以快速、有效地检测到在全基因组范围内DNA与蛋白结合位点、转录因子结合位点(transcription factor binding site,TFBS)、组蛋白翻译后修饰(histone post-translation modifications,hPTMs)、核小体定位和DNA甲基化等.然而,长期以来ChIP-seq需要大量细胞来生成高质量数据集,这限制了 ChIP在一些细胞数较低的样本如卵母细胞、早期胚胎细胞等研究领域的应用.近年来,在ChIP的基础上,研究人员提出了一系列降低样品起始量和实验成本、提高测序质量的低起始量ChIP-seq方法,促进了表观基因组学的发展.本文综述了 ChIP原理和降低起始量的ChIP的方法学发展,并对其中几种比较重要的方法进行了比较,并总结了低起始量的ChIP-seq在表观遗传学研究中的应用.本文最后对低起始量ChIP技术的应用和发展进行了展望,为低细胞数样品在低起始量ChIP的选择提供了参考.