基于生物信息学分析焦亡相关基因在结肠癌预后中的价值OACSTPCD

目的:采用生物信息学探讨焦亡相关基因在结肠癌患者预后中的价值.方法:从TCGA和GTEx数据库中提取正常结肠组织和结肠癌组织焦亡相关基因,并进行差异分析.根据焦亡相关基因表达对TCGA队列中的患者进行聚类及分型,对分型存在差异的基因进行单因素COX分析、lasso回归分析并构建预后模型.在GSE39582中对该预后模型进行验证.单因素和多因素COX回归分析风险模型、临床性状与结肠癌患者预后的相关性.对风险差异表达基因进行GO富集分析、KEGG通路分析和ssGSEA分析.结果:47个焦亡相关基因在正常组织和结肠癌组织中差异表达(P<0.05).预后模型中,患者生存时间与状态、临床分级、病理分期差异显著(P<0.001).GO和KEGG分析发现风险差异基因在免疫相关通路显著富集.ssGSEA分析提示高风险组和低风险组患者免疫细胞浸润和免疫功能存在差异.结论:焦亡相关基因可评估结肠癌患者预后,且可能调节结肠癌免疫相关通路.