生防菌株贝莱斯芽孢杆菌HNU24全基因组测序及分析OACSTPCD
Analysis of the Whole Genome Sequence of Biocontrol Strain Bacillus velezensis HNU24
本研究旨在解析对茄雷尔氏菌(Ralstonia solanacearum)具有较强拮抗活性的生防菌株HNU24的基因组特征.采用BGISEQ-500和ONT PromethION平台相结合的策略,对HNU24的全基因组进行了测序、组装、基因预测与功能注释、蛋白质同源分析.遗传进化分析结果表明:HNU24为贝莱斯芽孢杆菌(Bacillus velezensis),其完整基因组序列长度为3932768 bp,GC含量46.48％,编码3822个基因,其中有43个碳水化合物活性酶基因家族.纤维素酶活性实验进一步表明其具有分解纤维素的能力.在HNU24基因组中预测到13个次级代谢产物生物合成基因簇,其中包含表面活性素(surfactin)、泛革素(fengycin)、植物唑霉素(plantazolicin)、大环内酰亚胺(macrolactin)、杆菌烯(bacillaene)、地非西丁(difficidin)、杆菌毒素(bacillibactin)和杆溶菌素(bacilysin)8种已报道的对青枯菌等病原菌有拮抗活性的化合物.5个未能比对到同源基因或相似度较低,可能为未鉴定和报道的新化合物.此外,盆栽试验表明HNU24对番茄具有显著的促生长作用.综上,HNU24可能通过分泌活性化合物来拮抗茄雷尔氏菌并促进番茄生长,是一种潜在的生物肥料菌株,相关结果为进一步开展HNU24在生物防治方面的研究和应用奠定基础.
曹秀兰;叶雨婷;马天浩;胡安娜;曹宇;陈鹏泽;伍壮生;李鹏
海南师范大学/热带岛屿生态学教育部重点实验室/海南省热带动植物生态学重点实验室,海南海口 571158海南师范大学/热带岛屿生态学教育部重点实验室/海南省热带动植物生态学重点实验室,海南海口 571158海南师范大学/热带岛屿生态学教育部重点实验室/海南省热带动植物生态学重点实验室,海南海口 571158海南师范大学/热带岛屿生态学教育部重点实验室/海南省热带动植物生态学重点实验室,海南海口 571158海南师范大学/热带岛屿生态学教育部重点实验室/海南省热带动植物生态学重点实验室,海南海口 571158海南师范大学/热带岛屿生态学教育部重点实验室/海南省热带动植物生态学重点实验室,海南海口 571158海南省农业科学院蔬菜研究所,海南海口 571100海南师范大学/热带岛屿生态学教育部重点实验室/海南省热带动植物生态学重点实验室,海南海口 571158
农业科技
贝莱斯芽孢杆菌番茄青枯病全基因组次级代谢产物
《热带作物学报》 2023 (5)
905-913,9
海南省重点研发计划项目(No.ZDYF2020080).
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