单细胞水平解析人牙龈间充质干细胞异质性OACSTPCD

利用单细胞转录组测序解析牙龈干细胞(gingival mesenchymal stem cells,GMSCs)内部功能亚群及异质性.体外分离培养、鉴定人GMSCs,利用 10×scRNA-seq平台对GMSCs进行单细胞测序,根据细胞的基因表达差异进行分群,分析各亚群表面标记物表达情况,比较各亚群的细胞周期差异,成骨、成脂、成软骨分化基因表达差异以及基因表达谱差异,并分析各亚群细胞间的相互作用.成功提取到人GMSCs,呈旋涡状贴壁生长.单细胞测序分析结果显示GMSCs由 9 个细胞亚群构成,高表达表面标记物ENG、NT5E、THY1、ITGB1 和CD44,阴性表达CD34、CD14、PECAM1、PTPRC.GMSCs总体G2/M期所占比例为41.59%;亚群 6 的G2/M期比例最低(16.44%);而亚群 2 最高(99.08%).成脂、成软骨、成骨相关基因在 9 个细胞亚群中的表达不完全相同;9 个亚群具有不同的基因表达谱,亚群 2/4 具有较高的相似性,相对高表达TOP2A、UBE2C、KPNA2、CENPF等基因;亚群 5 高表达DKK1、KRT7、ID1 等基因;亚群 9 高表达MALAT1、FN1、NEAT1 等基因.GO分析显示各个亚群富集不同的通路.亚群 9 与其他亚群间的通讯最为活跃.单细胞水平研究提示GMSCs存在不同的功能亚群,且各个亚群的增殖能力、基因组表达谱具有异质性.