天仙藤全长转录组测序及分析OACSTPCD
Sequencing and Analysis of Full-length Transcriptome of Fibraurea recisa Pierre
目的:获得天仙藤全长转录组数据库,挖掘天仙藤功能基因.方法:采用PacBio SequeⅠ高通量测序系统,对天仙藤的茎、叶、果 3 个部位的混合样品进行全长转录组测序及分析.结果:共获得 176 354 条环形一致性序列(CCS),获得 184 439 个高质量isoforms,并注释了 139 826 个isoforms,检测出 3058 个转录因子和 135 527 个简单序列重复(SSR)位点,还预测到 76 862 个长链非编码RNA(lncRNA)和 36 204 个mRNAs.结论:获得了较可靠的天仙藤全长转录组数据,可为深入研究天仙藤基因组、生物学特性、相关代谢途径、信号通路及其分子机制提供数据支持.
黄素华;汤丹峰;缪剑华;韦范;全昌乾;唐美琼;胡营;韦筱媚;朱艳霞;韦坤华;黄媛
广西壮族自治区药用植物园 广西药用资源保护与遗传改良重点实验室/广西壮族自治区中药资源智慧创制工程研究中心,广西 南宁 530023||广西医科大学 药学院,广西 南宁 530023广西壮族自治区药用植物园 广西药用资源保护与遗传改良重点实验室/广西壮族自治区中药资源智慧创制工程研究中心,广西 南宁 530023广西壮族自治区药用植物园 广西药用资源保护与遗传改良重点实验室/广西壮族自治区中药资源智慧创制工程研究中心,广西 南宁 530023广西壮族自治区药用植物园 广西药用资源保护与遗传改良重点实验室/广西壮族自治区中药资源智慧创制工程研究中心,广西 南宁 530023广西壮族自治区药用植物园 广西药用资源保护与遗传改良重点实验室/广西壮族自治区中药资源智慧创制工程研究中心,广西 南宁 530023广西壮族自治区药用植物园 广西药用资源保护与遗传改良重点实验室/广西壮族自治区中药资源智慧创制工程研究中心,广西 南宁 530023广西壮族自治区药用植物园 广西药用资源保护与遗传改良重点实验室/广西壮族自治区中药资源智慧创制工程研究中心,广西 南宁 530023广西壮族自治区药用植物园 广西药用资源保护与遗传改良重点实验室/广西壮族自治区中药资源智慧创制工程研究中心,广西 南宁 530023广西壮族自治区药用植物园 广西药用资源保护与遗传改良重点实验室/广西壮族自治区中药资源智慧创制工程研究中心,广西 南宁 530023广西壮族自治区药用植物园 广西药用资源保护与遗传改良重点实验室/广西壮族自治区中药资源智慧创制工程研究中心,广西 南宁 530023广西壮族自治区药用植物园 广西药用资源保护与遗传改良重点实验室/广西壮族自治区中药资源智慧创制工程研究中心,广西 南宁 530023
中医学
天仙藤全长转录组测序分析功能注释
Fibraurea recisa Pierrefull-length transcriptomesequencing and analysisfunction annotation
《中国现代中药》 2023 (7)
1473-1485,13
国家自然科学基金项目(82260750)广西创新驱动发展专项(桂科AA18242040)广西科技计划项目(桂科AD22080012)对发展中国家科技援助项目(KY201904001)中央引导地方科技发展资金项目(桂科ZY22096020)
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