基于SSR分子标记构建19个杧果品种(系)的DNA指纹图谱OACSCDCSTPCD
Construction of DNA Fingerprint of 19 Mango Cultivars(lines)Based on SSR Molecular Markers
杧果(Mangifera indica Linn.)是一种热带亚热带常绿乔木果树,果实香甜、营养丰富、肉质细滑多汁,富有"热带果王"之美誉.为了加速杧果品种(系)的分子鉴定,本研究根据 19 份试验材料的表型特征,选择其差异较大的 5 份杧果材料(红象牙杧、金煌杧、红杧 6 号、红玉杧、南逗迈 4 号杧)为模板,进行SSR标记引物筛选,PAGE电泳检测筛选得到多态性较好的引物;将得到的引物再采用 HEX、FAM两个荧光标记进行 5'端修饰,再通过毛细管电泳技术检测,其扩增片段大小通过数字和字母对每对引物的多态性位点进行编码,构建杧果的DNA指纹图谱和DNA分子身份证.结果表明:经PCR扩增以及PAGE电泳检测,从已开发得到 115 对SSR标记引物中筛选得到 9 对稳定性较好、多态性好的引物,引物名称分别为M9、M15、M35、M40、M53、M59、M101、M102、M103.经毛细管电泳检测,结合"数字+字母"处理获得 19 个杧果品种(系)的指纹图谱代码,如金煌杧的指纹图谱代码为 9EE9F8933,黔山杧 2 号的指纹图谱代码为H6F7564IC,黔山杧 4 号的指纹图谱代码为 3DGE47279.以 19 份材料的指纹图谱代码和基本信息为载体,通过在线条形码生成程序、二维码生成程序生成其条形码DNA分子身份证、二维码DNA分子身份证.该研究结果为标准化构建杧果DNA分子身份证库奠定基础,为杧果遗传育种、优异基因挖掘提供数据参考.
刘荣;张正学;刘清国;党志国;吴小波;黄海
贵州省亚热带作物研究所,贵州贵阳 550006贵州省亚热带作物研究所,贵州贵阳 550006贵州省亚热带作物研究所,贵州贵阳 550006中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所,海南海口 571101贵州省亚热带作物研究所,贵州贵阳 550006贵州省亚热带作物研究所,贵州贵阳 550006
园艺学与植物营养学
杧果SSR标记毛细管电泳DNA指纹图谱DNA分子身份证
mangoSSR markerscapillary eletrophoresisDNA fingerprintDNA molecular identification
《热带作物学报》 2023 (9)
1745-1753,9
贵州省科技支撑计划项目(黔科合支撑[2020]1Y014 号)财政部和农业农村部国家现代农业产业技术体系资助项目(No.CARS-31-24)国家重点研发计划项目(No.2022YFD1100304).
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