玉米B3基因家族全基因组鉴定及表达模式OACSCDCSTPCD
Genome wide identification and expression pattern analysis of B3 gene family in maize
B3基因家族是植物中特有的转录因子家族,在植物生长发育及胁迫响应中有重要作用.为探究B3基因家族在玉米(Zea mays)中的基本信息及生长发育和逆境胁迫中的生物学功能,本研究对玉米全基因组B3家族成员进行鉴定并分析相关信息,依据转录组数据分析B3基因家族组织特异性表达及胁迫处理下的表达响应.结果显示,玉米B3基因家族包含88个成员,分为ABI、ARF、HSI、RAV和REM 5个亚家族,均含有B3结构域,同一个亚族成员的基因结构及保守基序(数量、类型)相似.分析发现,B3成员基因的启动子区域中均富含激素及逆境响应等功能元件.组织特异性表达分析结果显示,大部分B3基因在分生组织中优势表达.对B3家族成员在冷、热、盐、紫外和干旱这5种胁迫因子的响应表达分析显示,5个亚家族成员均可不同程度参与响应冷、热、盐、紫外和干旱胁迫因子,其中HSI亚家族中的所有成员均参与了对紫外胁迫因子的响应途径.以上结果阐明了B3基因家族在玉米全基因组中的分布、结构和系统发育特征,并依据玉米转录组数据,初步推测其在生长发育和胁迫应激响应中发挥重要作用,为深入研究B3基因家族在玉米中的功能与分子机制提供了数据基础.
仝帧翰;张严玲;王雷立;李安然;王闻琦;王盼盼;刘洪畅;刘青青;王翠玲
河南科技大学农学院, 河南洛阳 471023河南科技大学农学院, 河南洛阳 471023河南科技大学农学院, 河南洛阳 471023河南科技大学农学院, 河南洛阳 471023河南科技大学农学院, 河南洛阳 471023河南科技大学农学院, 河南洛阳 471023河南科技大学农学院, 河南洛阳 471023河南科技大学农学院, 河南洛阳 471023河南科技大学农学院, 河南洛阳 471023
玉米B3家族生物信息学系统进化分析生长发育非生物胁迫表达分析
Zea maysB3 familybioinformaticsphylogenetic analysisgrowth and developmentabiotic stressexpression analysis
《草业科学》 2023 (10)
2556-2570,15
国家自然科学基金河南省联合基金项目(U2004153)国家自然科学基金青年基金项目(31901561)河南省重点研发与推广专项(222102110002)
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