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淡水鱼类环境DNA宏条形码引物的筛选及其在千岛湖的应用OACSTPCD

Screening of primers for environmental DNA metabarcoding of freshwater fish and its ap-plication in Lake Qiandaohu

中文摘要英文摘要

基于环境DNA(eDNA)技术的鱼类多样性监测方法因具有灵敏度高、对目标生物无伤害以及成本低等特点,近年来在国内外得到了广泛应用.eDNA方法的有效性往往取决于宏条形码引物的选择,尽管目前已经有一些鱼类环境DNA宏条形码引物,但较少有研究综合评估这些引物的检出效果.本研究评估了来自COI、Cytb、12S rRNA和16S rRNA基因的29对鱼类eDNA宏条形码引物(包括本研究设计的2对和从国内外文献中引用的27对引物),首先基于计算机模拟PC…查看全部>>

In recent years,environmental DNA(eDNA)technology for monitoring fish diversity have been used worldwide due to its high sensitivity,harmlessness to target organisms and low cost.However,the effectiveness of eDNA methods depends on the se-lection of metabarcoding primers.Although some environmental DNA metabarcoding primers for fish are available,few studies have comprehensively evaluated the detection effectiveness of these primers.In this study,29 pairs of…查看全部>>

周严;童璐;胡文静;李志力;郝雷;刘其根;胡忠军

上海海洋大学,农业农村部鱼类营养与环境生态研究中心,上海 201306||上海海洋大学,农业农村部淡水水产种质资源重点实验室,上海 201306上海海洋大学,农业农村部鱼类营养与环境生态研究中心,上海 201306||上海海洋大学,农业农村部淡水水产种质资源重点实验室,上海 201306上海海洋大学,农业农村部鱼类营养与环境生态研究中心,上海 201306||上海海洋大学,农业农村部淡水水产种质资源重点实验室,上海 201306上海海洋大学,农业农村部鱼类营养与环境生态研究中心,上海 201306||上海海洋大学,农业农村部淡水水产种质资源重点实验室,上海 201306上海海洋大学,农业农村部鱼类营养与环境生态研究中心,上海 201306||上海海洋大学,农业农村部淡水水产种质资源重点实验室,上海 201306上海海洋大学,农业农村部鱼类营养与环境生态研究中心,上海 201306||上海海洋大学,农业农村部淡水水产种质资源重点实验室,上海 201306上海海洋大学,农业农村部鱼类营养与环境生态研究中心,上海 201306||上海海洋大学,农业农村部淡水水产种质资源重点实验室,上海 201306

eDNADNA宏条形码生物多样性计算机模拟PCR引物千岛湖

eDNADNA metabarcodingbiodiversityin silico PCRprimersLake Qiandaohu

《湖泊科学》 2024 (1)

187-199,13

国家重点研发计划重点专项(2019YFD0900605)资助.

10.18307/2024.0131

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