产活性氧假交替单胞菌GCY全基因组序列分析OACSTPCD
Whole-genome sequence analysis of Pseudoalteromonas sp.GCY with capability of producing reactive oxygen species
生物源活性氧(reactive oxygen species,ROS)是环境ROS的重要来源,在生物元素地球化学循环中发挥着重要作用.但目前关于产ROS微生物的生物学信息尚不完善,影响微生物ROS产生的因素也未知.为此从近海沉积物中分离得到一株产胞外ROS的假交替单胞菌GCY(Pseudoalteromonas sp.GCY),利用全基因组测序表征了其潜在生物学功能.结果表明菌株GCY基因组大小为5.47Mb,GC含量为43.39％,与胞外ROS产生相关的基因包括lodA、lodB和nqrA-F等.此外,氨基酸和Na+被证实影响胞外ROS的产生.进一步通过比较基因组分析,推测具备产胞外ROS能力的微生物在环境中广泛存在.综上,提供了产胞外ROS微生物全基因组分析报告,在分子水平上加深了对生物源ROS产生的理解,为开发利用各种环境中生物源ROS及认知生物源ROS的环境意义提供了重要视角.
岳昊;吴硕;王竞;李泽龙;顾晨
大连理工大学 环境学院 ,辽宁 大连 116024中国电建集团华东勘测设计研究院有限公司 ,浙江 杭州 311122
环境科学
活性氧(ROS)微生物全基因组影响因素
reactive oxygen species (ROS)microorganismswhole-genomeinfluence factor
《大连理工大学学报》 2024 (001)
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国家自然科学基金资助项目(21876018,42177375).
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