基于转录组测序的卵巢癌铁死亡差异基因筛选及生物信息学分析OACSCDCSTPCD
Identification of differential genes and bioinformatics analysis related to ferroptosis in ovarian cancer based on transcriptome sequencing
目的 探究卵巢癌铁死亡关键差异基因及其潜在作用机制.方法 基于Illumina测序平台对铁死亡诱导剂大鼠肉瘤基因选择性致死化合物3(RSL3)给药后的卵巢癌OVCAR8细胞株进行转录组测序.采用DESeq2算法筛选卵巢癌铁死亡差异基因,并采用基因本体(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)、基因集富集分析(GSEA)和蛋白互作网络(PPI)分析对差异基因富集的分子功能和信号通路进行综合分析.结果 转录组测序数据质控合格,平均比对率为(0.9…查看全部>>
Objective This study aims to explore key differential genes and potential mechanisms related to ferroptosis in ovarian cancer.Methods Transcriptome sequencing was conducted on the ovarian cancer cell line OVCAR8 after treatment with the ferroptosis inducer ras-selective lethal 3(RSL3),utilizing the Illumina sequencing platform.The DESeq2 algorithm was applied to identify differential genes associated with ferroptosis in ovarian cancer.A comprehensive analysi…查看全部>>
刘易陇;何霞;宋学武;童荣生
电子科技大学医学院,四川成都 610054||乐山市人民医院药学部,四川乐山 614000||四川省医学科学院·四川省人民医院/电子科技大学附属医院药学部个体化药物治疗四川省重点实验室,四川成都 610072电子科技大学医学院,四川成都 610054||四川省医学科学院·四川省人民医院/电子科技大学附属医院药学部个体化药物治疗四川省重点实验室,四川成都 610072电子科技大学医学院,四川成都 610054||四川省医学科学院·四川省人民医院/电子科技大学附属医院药学部个体化药物治疗四川省重点实验室,四川成都 610072电子科技大学医学院,四川成都 610054||四川省医学科学院·四川省人民医院/电子科技大学附属医院药学部个体化药物治疗四川省重点实验室,四川成都 610072
药学
卵巢癌大鼠肉瘤基因选择性致死化合物3铁死亡转录组测序
ovarian cancerras-selective lethal 3ferroptosistranscriptome sequencing
《中国临床药理学杂志》 2023 (24)
3660-3663,4
国家重点研发计划基金资助项目(2020YFC2005500)国家自然科学基金面上资助项目(72174038)四川省科技厅重点研发计划基金资助项目(2022YFS0272)四川省医院协会青年药师科研专项基金资助项目(22008)个体化药物治疗四川省重点实验室开放课题资助项目(2021ZD02)四川省医学科学院·四川省人民医院科研基金资助项目(2020LY06)
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