eMD:基于异构计算的大规模分子动力学模拟软件OA
【目的】异构计算已经成为高性能计算的重要组成部分,GPU异构计算可显著提速计算密集型的分子动力学模拟应用,本文介绍自研分子动力学模拟软件eMD的系统设计及其异构计算应用。【方法】首先介绍eMD软件的目标定位,包括应用功能和计算性能两方面;然后介绍软件概要设计,包括框架、模块和接口等组成部分;重点围绕面向异构计算的软件架构设计和移植优化技术进行阐述。【结果】eMD软件系统基于GPU异构计算可实现大规模体系模拟,同时提供特色的分子动力学模拟算法和模型…查看全部>>
徐顺;张宝花;刘倩;金钟
中国科学院计算机网络信息中心,北京100083中国科学院计算机网络信息中心,北京100083中国科学院计算机网络信息中心,北京100083中国科学院计算机网络信息中心,北京100083
计算机与自动化
分子动力学GPU异构计算并行计算国产超算
《数据与计算发展前沿》 2024 (1)
P.21-34,14
国家重点研发计划课题“多物理复杂体系科学计算应用平台”(2020YFB0204802)甘肃省科技计划项目“甘肃省生物医药高性能计算示范平台”(21YF5GA005)。
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