产气荚膜梭菌α-毒素基因数字PCR方法的建立及其在标准物质研制方面的应用OACSTPCD
产气荚膜梭菌(Clostridium perfringens)是一种重要的人兽共患病原菌,α-毒素是其分子生物学检测的主要靶标。试验选取Clper引物及探针建立微滴式数字PCR(droplet digtial PCR,ddPCR)方法,最佳引物浓度0.85μmol/L,探针浓度为0.3μmol/L,退火温度为60℃。利用建立的ddPCR方法检测单核细胞增生李斯特菌、沙门氏菌、大肠杆菌、肠球菌、金黄色葡萄球菌、弯曲杆菌的DNA,结果均为阴性,表明该方法具有较好的特异性。合成产气荚膜梭菌α-毒素基因,制成DNA标准品,选取3个稀释梯度的标准品进行重复试验,组内和组间变异系数均小于5%,证明该方法具有较好的重复性。采用7个稀释梯度的标准品进行重复检测,计算出该方法的检测限为12.39 copies/μL,定量限为33.97 copies/μL。通过对68份临床样品进行检测,证实该方法可用于临床,且用于检测质粒DNA时无明显的基质效应。应用ddPCR方法对标准品进行均匀性和稳定性检验,并联合9家实验室进行定值,最终获得了国家市场监督管理总局颁发的标准物质证书(GBW(E)091237)。α-毒素基因ddPCR方法的建立和DNA标准物的研制,为产气荚膜梭菌分子生物学检测试剂的标准化奠定了基础。
张铭洋;张喜悦;赵格;曲志娜;高宏伟;孙敏;程慧敏;徐佳微;王君玮;邹明;
青岛农业大学动物医学院,山东青岛266000 中国动物卫生与流行病学中心,山东青岛266032中国动物卫生与流行病学中心,山东青岛266032青岛海关技术中心,山东青岛266000青岛农业大学动物医学院,山东青岛266000
畜牧业
产气荚膜梭菌ddPCRα-毒素基因标准物质特异性灵敏度可重复性定值
《山东农业科学》 2024 (001)
P.156-163 / 8
国家重点研发计划项目(2022YFD1301003,2022YFC2303900);山东省重点研发计划项目(2022CXGC010606-01-05);中国动物卫生与流行病学中心创新基金项目“单增李斯特菌等致病菌标准物质研究”(DW2021001-13)。
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