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TBX2在葡萄膜黑色素瘤的预后和机制探索OA

中文摘要

目的:探究T盒转录因子2(T-box transcription factor 2,TBX2)在葡萄膜黑色素瘤(uveal melanoma,UVM)中的表达水平、生存预后、免疫浸润相关性。方法:首先通过TIMER2.0数据库分析正常组织和肿瘤组织中TBX2表达和临床特征,从UCSC Xena数据库下载泛癌的生存数据,使用Cox比例风险模型和Kaplan-Meier曲线分析评估TBX2对预后的预测价值。然后使用cBioPortal数据库分析人源TBX2突变前后生存改变,通过BloodSpot和TIMER2.0数据库探究TBX2与癌症免疫浸润之间的相关性。癌症单细胞状态图谱和基因集变异分析(gene set variation analysis,GSVA)探究其表达与分子机制的相关性。结果:15种肿瘤类型的TBX2 mRNA表达水平显著改变,TBX2是肾上腺皮质癌(adrenocortical carcinoma,ACC)、肾乳头状细胞癌(kidney renal papillary cell carcinoma,KIRP)、UVM典型的生存预后标志物。其突变与生存状态无明显相关性,在UVM中T淋巴细胞浸润水平提高导致不良预后风险升高。此外,在UVM中TBX2通路富集至ATP结合盒(ATP-binding cassee transporter,ABC)转运蛋白、DNA修复和损伤。结论:TBX2在UVM的生存和免疫浸润中起着关键作用,将来可能作为一种UVM预后及免疫治疗效果的预测因子。

昝雨欣;毛爱秋;丁妍

湖北医药学院生物医药研究院,十堰442000湖北医药学院第一临床学院,十堰442000湖北医药学院附属太和医院生命科学研究所,十堰442000 胚胎干细胞研究湖北省重点实验室,十堰442000

临床医学

T盒转录因子2预后免疫生物信息学葡萄膜黑色素瘤

《眼科学报》 2023 (11)

P.746-755,10

10.12419/2312180001

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