花生赤霉素3-β-双加氧酶(AhGA3ox)基因家族的全基因组鉴定及表达分析OA北大核心CSTPCD
赤霉素3-β-双加氧酶(gibberellin 3-beta-dioxygenase,GA3ox)是参与赤霉素生物合成的关键酶之一,可通过影响赤霉素的形成调控植物的生长发育,目前在花生中尚无系统研究。本研究利用生物信息学方法在花生栽培种基因组数据库中筛选花生GA3ox家族基因,对鉴定出的7个AhGA3ox在栽培种花生基因组中的分布、结构及进化特征、理化性质、启动子顺式作用元件进行分析,并利用qRT-PCR技术对其进行花生组织结构表达模式分析,同时对AhGA3ox家族基因在不同荚果大小的2个花生品系中的表达量进行分析。结果表明,7个AhGA3ox基因分布在7条染色体上,均由1个内含子和2个外显子组成。花生AhGA3ox蛋白中均包含1个DIOX_N结构域和1个2OG-FeII_Oxy结构域,系统进化分析表明与大豆的亲缘关系较近,在根、茎、叶、花、果针5个组织中呈现出不同表达模式,不仅在花生果壳不同发育时期的表达量不同,在2个荚果大小不同的花生品系果壳相同发育时期的表达量也不相同,但多数发育时期在大果品系中的表达量均显著高于小果品系,推测该家族基因的表达可能对荚果的形成具有促进作用。
李海芬;鲁清;刘浩;温世杰;王润风;黄璐;陈小平;洪彦彬;梁炫强;
广东省农业科学院作物研究所/广东省农作物遗传改良重点实验室/国家油料作物改良中心南方花生分中心,广东广州510640
农业科学
花生GA3ox表达分析生物信息学功能分析
《作物学报》 2024 (004)
P.932-943 / 12
广东省“十四五”农业科技创新十大重点项目公开竞争计划(2022SDZG05);广东省重点研发计划-现代种业(2020B020219003,2022B0202060004);财政部和农业农村部国家现代农业产业技术体系建设专项(CARS-13);国家自然科学基金项目(32001442,32172051);广东省基础与应用基础研究基金项目(2021A1515010811,2023A1515010098);广东省农业和农村厅科技专项资金项目(2019KJ136-02);广东省海外名师计划项目(207124505346);广东省农业科学院农业优势产业学科团队建设项目(202104TD)资助。
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