类风湿关节炎生物标志物开发及潜在治疗中药预测OACSTPCD

目的预测类风湿关节炎(RA)生物标志物及RA潜在治疗中药。方法从GPL96平台的相关数据集中采集33例RA患者(RA组)和20例健康者(HC组)的mRNA表达谱,使用limma R包筛选差异表达基因(DEGs),以基因本体论(GO)功能富集和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析验证。构建加权基因共表达网络,采用机器学习等方法,筛选出潜在的核心基因及生物标志物。采用反转录聚合酶链反应(RT-PCR)法和Western blot法验证生物标志物。利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)预测潜在可用于治疗RA的中药。结果CKAP2为RA潜在的生物标志物。CKAP2的表达水平与CD_(8)^(+)T淋巴细胞、浆细胞和CD27水平呈显著正相关(P<0.01)。预测出苍耳子、黄芩、党参等11种中药对RA有潜在治疗作用。结论CKAP2可作为RA早期诊断的候选生物标志物,苍耳子、黄芩、党参等11种中药对RA具有潜在治疗作用。该研究为治疗RA的中药研发提供了新思路。