类风湿关节炎活动期患者血浆外泌体miRNAs差异表达筛选与生物信息学分析及验证OACSTPCD
目的筛选类风湿关节炎(rheumatoid arthritis,RA)活动期患者和健康体检者血浆外泌体(exosomes)中差异表达的微小核糖核酸(microRNAs,miRNAs),并进行生物信息学分析,以探讨血浆外泌体miRNAs在RA致病中的作用及其潜在临床应用价值。方法选取2023年01~04月就诊于苏州大学附属第二医院风湿免疫科的39例RA患者作为研究对象,同时选取39例健康体检者作为正常对照。利用Illumina高通量测序技术检测血浆外泌体中miRNAs的表达水平,以log2(Fold Change)绝对值>1和P值<0.05为条件获得差异表达的miRNAs。按照P值从小到大的顺序挑选6条miRNAs进行生物信息学分析,并利用实时荧光定量PCR(quantitative real-time fluorescence PCR,qRT-PCR)验证。结果与对照组相比,RA患者血浆外泌体中存在22条异常表达的miRNAs,4条上调,18条下调。其中,miR-30b-5p,miR-144-3p,miR-20a-5p,miR-223-5p,miR-425-3p和miR-589-5p的水平变化显著。GO和KEGG富集分析结果显示,差异表达的miRNAs可能通过调节转化生长因子-β(TGF-β)和PI3K/AKT信号通路参与疾病进展,涉及Th17细胞分化、细胞间相互作用和蛋白磷酸化等生物学过程。qRT-PCR验证结果显示,与对照组相比,RA患者血浆外泌体miR-144-3p和miR-425-3p的表达水平明显降低,差异具有统计学意义(t=3.617,3.595,均P<0.001),而miR-30b-5p,miR-223-5p,miR-589-5p和miR-20a-5p的表达差异均无统计学意义(t=1.956,1.331,1.662,1.861,均P>0.05)。结论RA患者血浆外泌体的miRNAs表达谱发生改变,可能通过TGF-β等信号通路参与疾病进展,外泌体miR-144-3p和miR-425-3p是RA疾病诊断的潜在血清学标志物。
陆健;冯萍;吴静;杨欢;
苏州大学附属第二医院,江苏苏州215004苏州市广济医院,江苏苏州215137
临床医学
类风湿关节炎外泌体微小核糖核酸生物信息学分析
《现代检验医学杂志》 2024 (002)
P.62-67 / 6
江苏省卫健委医学科研项目(Z 2023043):类风湿关节炎相关血浆外泌体miR-144-3p活化B细胞促进自身抗体产生及其应用价值的研究;江苏省妇幼保健协会科研项目(FYX202123):血清及血清外泌体来源的hsa_circ_0065214在乳腺癌中的作用机制及临床应用研究;苏州市科技计划项目(关键技术)(SKY2021045):血清及血清外泌体来源circSCAP_020作为乳腺癌新型肿瘤标志物的技术应用研究;苏州大学附属第二医院科研预研基金(SDFEYBS2203):类风湿性关节炎患者血浆外泌体调控B细胞异常分化及其致病机制研究。
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