一种外三元纯种猪、二元猪、三元猪和多元回交猪的鉴定方法研究OA北大核心CSTPCD

【目的】获得外三元猪品种鉴定的有效基因型并建立系统的猪种质鉴定方案,为外三元猪种质鉴定提供思路。【方法】本研究对613头杜洛克猪Illumina 60K芯片、503头长白猪Illumina中芯一号50K芯片及10头大白猪重测序数据进行纯合位点统计分析,筛选获得常染色体上杜洛克猪、长白猪、大白猪的特异性单核苷酸多态性(SNP)位点。以120头不同品系不同品种猪耳组织DNA为模板进行PCR扩增,并测序验证特异性SNP位点,筛选有效的特异性基因位点,通过位点联合分析建立外三元纯种、二元、三元及多元回交猪品种鉴定方案。【结果】通过芯片数据比对共获得6个长白猪特有SNPs位点,8个杜洛克猪特有的SNPs位点,1个大白猪特有SNP位点。测序验证结果显示有效SNPs位点分别为SSC13:57293969 A>G、SSC11:47494227 T>G、SSC6:110653413 T>C和SSC6:110653219 T>C。根据位点突变类型及遗传规律,制定了三位点联合分析的种质鉴定方案,并鉴定出长白纯种猪、多元回交长白猪等多个猪种。【结论】本研究利用猪种特异性SNP位点制定了外三元纯种、二元、三元及多元回交猪品种鉴定方案。试验结果为外三元猪种质鉴定提供参考和技术支撑。