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基于网络药理学探究滇黄精抗疲劳作用及其机制OA北大核心

中文摘要

【目的】基于网络药理学探究滇黄精(Polygonatum kingianum)潜在的抗疲劳机制。【方法】使用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、CNKI和DrugBank数据库搜寻滇黄精的主要活性成分,并利用SwissTargetPrediction数据库预测各活性成分的作用靶点;通过Disgenet数据库获取与疲劳有关的靶点;借助Venny 2.1.0和Cytoscape v3.9.0构建滇黄精—活性成分—抗疲劳靶点网络,根据其节点度值筛选滇黄精的主要活性成分。通过String数据库构建蛋白质互作(protein-protein interaction,PPI)网络,通过节点度值筛选滇黄精抗疲劳的关键靶点。使用DAVID数据库对筛选的关键靶点进行基因本体论(gene ontology,GO)分析及京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析。使用AutoDock Vina软件对滇黄精的主要活性成分与抗疲劳关键靶点进行分子对接。【结果】获得滇黄精活性成分38种;预测得到滇黄精抗疲劳靶点30个;筛选出滇黄精抗疲劳的主要活性成分3个,分别是3′-甲氧基大豆苷元、黄芩素和β-谷甾醇。PPI网络分析结果表明:EGFR、STAT3、PTPN11、ERBB2、ESR1和JAK2为滇黄精抗疲劳的关键靶点。GO分析和KEGG通路分析表明:滇黄精抗疲劳作用主要涉及68个条目和39个通路。分子对接结果显示:滇黄精的主要活性成分与抗疲劳关键靶点结合稳定。【结论】本研究通过网络药理学构建了滇黄精—活性成分—抗疲劳拓扑网络,挖掘出滇黄精抗疲劳的主要活性成分及抗疲劳关键靶点,并对主要活性成分与关键靶点进行分子对接。研究结果为滇黄精的抗疲劳功效提供了理论依据。

张楠;杨帆;马仲帅;马舒韵;李曦明;温燕龙;李凌飞;

云南农业大学食品科学技术学院,云南昆明650201

农业科学

滇黄精抗疲劳网络药理学分子对接

《云南农业大学学报(自然科学版)》 2024 (001)

P.101-110 / 10

云南省重大科技专项(202402AE090011);云南省教育厅科学研究基金项目(2024Y294)。

10.12101/j.issn.1004-390X(n).202212048

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