小麦SUS基因家族鉴定与生物信息学分析OA北大核心
【目的】对小麦蔗糖合成酶(sucrose synthase,SUS)基因家族进行鉴定和生物信息学分析,为探究小麦SUS(TaSUS)基因家族的作用机制提供理论参考。【方法】采用生物信息学方法在小麦全基因组上鉴定TaSUS基因家族成员,并对其系统进化关系、染色体位置、基因结构、保守结构域、启动子顺式作用元件和基因表达模式进行分析。【结果】在小麦基因组中共鉴定到分布于14条染色体上的24个TaSUS基因,可分为3个亚组。TaSUS基因含有多个外显子,但部分基因缺失非翻译区结构。TaSUS基因家族成员启动子区域包含45种顺式作用元件,涉及植物生长发育和逆境胁迫响应。大多数TaSUS基因在小麦穗中显著表达,在叶、茎和根中的相对表达量较低。【结论】研究结果有助于了解小麦SUS基因家族的进化,为后期小麦SUS基因家族的生物功能研究奠定理论基础。
孔斌雪;李娜;马靖福;窦佳欣;陈涛;张沛沛;刘媛;杨德龙;
甘肃农业大学生命科学技术学院,甘肃兰州730070省部共建干旱生境作物学国家重点实验室,甘肃兰州730070甘肃农业大学生命科学技术学院,甘肃兰州730070 省部共建干旱生境作物学国家重点实验室,甘肃兰州730070
农业科学
小麦蔗糖合成酶(SUS)生物信息学分析基因表达
《云南农业大学学报(自然科学版)》 2024 (001)
P.1-8 / 8
中央引导地方科技发展资金项目(23ZYQA0322);甘肃省农业重点研发计划(21YF5NA089);甘肃省高等学校产业支撑计划项目(2022CYZC-44);甘肃省自然科学基金项目(21JR7RA828);甘肃省高等学校创新基金项目(2021B-125)。
评论