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基于网络药理学和分子对接探讨蒺藜治疗白癜风的作用机制OA

Based on network pharmacology and molecular docking to explore the mechanisms of the action of Tribulus terrestris in the treatment of vitiligo

中文摘要英文摘要

目的 基于网络药理学的方法,探讨蒺藜治疗白癜风的作用机制.方法 将口服生物利用度(OB)和类药性(DL)这两项筛选标准分别设定为OB≥30%和DL≥0.18,使用Cytoscape 3.9.1软件,通过中药系统药理数据库与分析平台(TCMSP)、OMIM、Swiss Target Prediction和GeneCards等多种主流数据库,筛选出蒺藜主要活性成分的作用靶点基因并构建"活性成分-作用靶点"网络,再将蒺藜主要活性成分的作用靶点基因与白癜风疾病靶点基因取交集,构建蒺藜治疗白癜风的"疾病-通路-靶点-成分-药物"网络.将交集作用靶点分别导入至STRING平台用以构建蛋白质相互作用(PPI)网络,导入DAVID数据库用以进行GO富集分析和KEGG通路富集分析.利用有机小分子生物活性数据库(PubChem)和蛋白质结构数据库(PBD)找出药物关键成分的小分子结构和疾病蛋白结构,设置受体与配体后对两者进行分子对接.结果 筛选出12种活性成分,包括山奈酚、蒺藜酰胺、异鼠李素、谷甾醇等,该活性成分可能在对应的71个靶点上发挥功效.依赖PPI网络分析,挖掘出RAC-α丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(AKT1)、肿瘤坏死因子(TNF)、雌激素受体1(ESR1)、过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARG)、造血前列腺素D合酶(HPGDS)、胱天蛋白酶3(CASP3)、前列腺素内过氧化物合酶2(PTGS2)等10个主要靶标.这些潜在的靶标参与细胞凋亡、肽基丝氨酸磷酸化、细胞对活性氧的响应等众多生物过程,其中包含多种信号通路,如细胞凋亡、肿瘤坏死因子信号通路、活性氧信号通路等.分子对接结果显示山奈酚、异鼠李素等主要活性成分与核心作用靶点AKT1、TNF、ESR1对接结合稳定,证明其核心成分可以通过结合多个核心蛋白,作用于关键靶点发挥调控作用.结论 蒺藜可能通过调节炎症、细胞凋亡、免疫功能、氧化应激等多个途径,来发挥对白癜风的治疗功效.

Objective This study was based on the network pharmacology to explore the mechanisms whereby Tribulus terrestris affects vitiligo.Methods The screening criteria for oral bioavailability(OB)and drug-likeness(DL)were set as OB≥30%and DL≥O.18,respectively.The databases of Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology and analysis platforms of OMIM,Swiss Target Prediction and GeneCards were used to screen out target genes of main active ingredients of Tribulus terrestris and construct an"active ingredients-target"network using Cyto-scape 3.9.1 software.Then the target genes of the main active ingredients of Tribulus terrestris and the target genes of vitiligo were intersected to construct a"disease-pathway-target-component-drug"network.In addition,the intersection targets were respectively imported into the STRING platform to construct Protein-Protein Interaction(PPI)Networks,and into the DAVID database for GO and KEGG pathway enrichment analyses.The structure of small molecules of key drug compo-nents and vitiligo-related protein structure were searched on PubChem and PBD.After setting up receptors and ligands,the molecular docking of these two was performed.Results Through screening,we identified 12 active ingredients,including kaempferol,terrestramide,isorhamnetin,sitosterol,which possibly affect 71 targets.PPI network analysis showed ten major targets,inclu-ding AKT1,TNF,ESR1,PPARG,HPGDS,CASP3,and PTGS2.These targets were involved in many biological processes,such as apoptosis,peptide serine phosphorylation,and cell response to reactive oxygen species,through various signaling pathways,including apoptosis,tumor necrosis factor and reactive oxygen species signaling.Molecular docking results showed that the main active components such as kaverol and isorhamnetin were stably bound to the core targets,such as AKT1,TNF and ESR1,the core components regulating key targets.Conclusion Tribulus terres-tris may improve vitiligo through regulating inflammation,apoptosis,immune function and oxida-tive stress.

彭怡;何玉清;李伟佳;黄巧;胡敏;潘素跃;王朴;戚嘉慧;江千帆;刘凌宇

广东医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系,广东医科大学医学系统生物学研究所,广东 东莞 523808广东医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系,广东医科大学医学系统生物学研究所,广东 东莞 523808||东莞市寮步医院,广东 东莞 523400广东医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系,广东医科大学医学系统生物学研究所,广东 东莞 523808广东医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系,广东医科大学医学系统生物学研究所,广东 东莞 523808广东医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系,广东医科大学医学系统生物学研究所,广东 东莞 523808广东医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系,广东医科大学医学系统生物学研究所,广东 东莞 523808广东医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系,广东医科大学医学系统生物学研究所,广东 东莞 523808广东医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系,广东医科大学医学系统生物学研究所,广东 东莞 523808广东医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系,广东医科大学医学系统生物学研究所,广东 东莞 523808广东医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系,广东医科大学医学系统生物学研究所,广东 东莞 523808

蒺藜白癜风网络药理学炎症细胞凋亡氧化应激作用机制

Tribulus terrestrisvitiligonetwork pharmacologyinflammationcell ap-optosisoxidative stressaction mechanism

《皮肤性病诊疗学杂志》 2024 (3)

TRPV3基因对角质细胞增殖分化的影响及其在角化性皮肤病中的作用机制研究

180-189,10

国家自然科学基金(81773312)广东省"扬帆计划引进紧缺拔尖"人才项目(201433005)广东省东莞市社会发展科技重点项目(20211800905552)

10.3969/j.issn.1674-8468.2024.03.006

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