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陆地棉TRM基因家族的鉴定及纤维品质相关优异单倍型分析OA北大核心CSTPCD

Identification of TRM gene family and fiber quality related excellent haplotype analysis in Gossypium hirsutum L.

中文摘要英文摘要

[目的]鉴定陆地棉TRM基因家族序列及理化性质,分析与棉纤维品质相关的优异单倍型基因差异.[方法]利用生物信息学分析陆地棉TRM基因家族进化关系、理化性质和聚类表达;利用基因单倍型效应分析筛选调控纤维品质性状(纤维长度、比强度、马克隆值)的候选基因.[结果]陆地棉TRM基因家族编码的氨基酸为376~1093,等电点为4.64~9.56.亚细胞定位预测发现多达60 个陆地棉TRM基因家族定位于细胞核中.TRM基因家族含有较多的光响应、激素响应、胁迫…查看全部>>

[Objective]Identification of TRM gene family and fiber quality related excellent haplotype a-nalysis in Gossypium hirsutum L.[Methods]Bioinformatics was used to analyze the evolutionary relationship,physicochemical properties and cluster expression of TRM gene families.Candidate genes regulating fiber quali-ty traits(fiber length,strength,and Macron value)were screened by gene haplotype analysis.[Results]The a-nalysis of physicochemical properties showed tha…查看全部>>

王凯迪;陈全家;高晨旭;裴文锋;杨书贤;张文庆;宋吉坤;马建江;王莉;于霁雯

新疆农业大学农学院/教育部棉花工程研究中心,乌鲁木齐 830052新疆农业大学农学院/教育部棉花工程研究中心,乌鲁木齐 830052棉花生物育种及产业技术国家工程中心/中国农业科学院棉花研究所,河南安阳 455000新疆农业大学农学院/教育部棉花工程研究中心,乌鲁木齐 830052||棉花生物育种及产业技术国家工程中心/中国农业科学院棉花研究所,河南安阳 455000棉花生物育种及产业技术国家工程中心/中国农业科学院棉花研究所,河南安阳 455000棉花生物育种及产业技术国家工程中心/中国农业科学院棉花研究所,河南安阳 455000新疆农业大学农学院/教育部棉花工程研究中心,乌鲁木齐 830052||棉花生物育种及产业技术国家工程中心/中国农业科学院棉花研究所,河南安阳 455000棉花生物育种及产业技术国家工程中心/中国农业科学院棉花研究所,河南安阳 455000棉花生物育种及产业技术国家工程中心/中国农业科学院棉花研究所,河南安阳 455000新疆农业大学农学院/教育部棉花工程研究中心,乌鲁木齐 830052||棉花生物育种及产业技术国家工程中心/中国农业科学院棉花研究所,河南安阳 455000

农业科学

陆地棉基因家族基因表达纤维品质单倍型

Gossypium hirsutum L.gene familygene expressionfiber qualityhaploidgenotype

《新疆农业科学》 2024 (3)

521-536,16

河南省农业良种联合攻关项目(2022010301)新疆维吾尔自治区自然科学基金项目(2021D01B113)中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(1610162022013) Henan Province Agricultural Improved Seed Joint Research Project(2022010301)Natural Science Foundation of Xinjiang Uygur Autonomous Region(2021D01B113)Basic Research Funds for Public Welfare Research Institutes of the Central Government(1610162022013)

10.6048/j.issn.1001-4330.2024.03.001

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