用于玉米品种真实性鉴定的最优核心SNP位点集的研发OA北大核心CSTPCD
Development of an optimal core SNP loci set for maize variety genuineness identification
品种真实性是种子质量监测的一个重要指标.为建立准确可靠、快速简便、高通量、低成本的玉米品种真实性鉴定技术,本文利用 200 个核心SNP位点构建的 5816 个玉米杂交品种,3274 个自交系的指纹数据,基于遗传算法、品种识别率评估确定了一套高鉴别力的核心SNP位点集,包含 96 个SNP位点.这 96 个SNPs全部位于基因内区域,相对均匀分布在 10 对染色体上.采用上述杂交品种和自交系的指纹数据评估显示这 96 个位点具有较高多态性和品种区…查看全部>>
Variety genuineness is an important indicator for seed quality monitoring.In order to establish accurate,reliable,fast,simple,high-throughput,and low-cost maize variety genuineness identification technology,we evaluated and determined a set of high discriminative power core SNP loci set including 96 SNPs based on SNP fingerprint data of 5816 maize hybrids and 3274 inbred lines using the genetic algorithm and variety recognition rate.All 96 SNPs were located …查看全部>>
田红丽;王凤格;赵久然;杨扬;范亚明;易红梅;王蕊;金石桥;晋芳;张云龙;刘亚维
北京市农林科学院玉米研究所 / 农业农村部农作物 DNA指纹创新利用重点实验室(部省共建) / 玉米 DNA指纹及分子育种北京市重点实验室, 北京 100097北京市农林科学院玉米研究所 / 农业农村部农作物 DNA指纹创新利用重点实验室(部省共建) / 玉米 DNA指纹及分子育种北京市重点实验室, 北京 100097北京市农林科学院玉米研究所 / 农业农村部农作物 DNA指纹创新利用重点实验室(部省共建) / 玉米 DNA指纹及分子育种北京市重点实验室, 北京 100097北京市农林科学院玉米研究所 / 农业农村部农作物 DNA指纹创新利用重点实验室(部省共建) / 玉米 DNA指纹及分子育种北京市重点实验室, 北京 100097北京市农林科学院玉米研究所 / 农业农村部农作物 DNA指纹创新利用重点实验室(部省共建) / 玉米 DNA指纹及分子育种北京市重点实验室, 北京 100097北京市农林科学院玉米研究所 / 农业农村部农作物 DNA指纹创新利用重点实验室(部省共建) / 玉米 DNA指纹及分子育种北京市重点实验室, 北京 100097北京市农林科学院玉米研究所 / 农业农村部农作物 DNA指纹创新利用重点实验室(部省共建) / 玉米 DNA指纹及分子育种北京市重点实验室, 北京 100097全国农业技术推广服务中心, 北京 100125全国农业技术推广服务中心, 北京 100125北京市农林科学院玉米研究所 / 农业农村部农作物 DNA指纹创新利用重点实验室(部省共建) / 玉米 DNA指纹及分子育种北京市重点实验室, 北京 100097北京市农林科学院玉米研究所 / 农业农村部农作物 DNA指纹创新利用重点实验室(部省共建) / 玉米 DNA指纹及分子育种北京市重点实验室, 北京 100097
玉米品种真实性鉴定SNP位点集高鉴别力
maize varietygenuineness identificationSNP loci sethigh discrimination power
《作物学报》 2024 (5)
1115-1123,9
本研究由国家科技创新重大项目(2022ZD04019)和北京市农林科学院财政项目(KJCX20230301,CZZJ202206)资助.This study was supported by the National Scientific and Technological Innovation-Major Projects(2022ZD04019)and the Financial Project of Beijing Academy of Agriculture and Forestry Sciences(KJCX20230301,CZZJ202206).
评论