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3种方法对1株临床疑难菌的鉴定及结果比较OACSTPCD

Identification of a clinically difficult bacterial strain by three methods and comparison of results

中文摘要英文摘要

目的 通过基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)、16 S rRNA序列分析和全基因组测序(WGS)对从临床标本中分离的 1 株疑似盐单胞菌进行菌种鉴定,比较 3 种方法的鉴定结果.方法 采用MALDI-TOF MS对待测菌进行蛋白质图谱收集,通过比对图谱特征峰实现菌种鉴定;对菌株进行16 S rRNA基因测序,将测序结果与数据库比对;待测菌 WGS 后进行序列比对分析,具体包括使用 ANIm 和ANIb 2 种方法计算平均…查看全部>>

Objective MALDI-TOF MS,16 S rRNA sequence analysis,and whole genome sequencing(WGS)were applied to identify a strain of suspected Halomonas isolated from a clinical specimen and to com-pare the results of the three methods.Methods MALDI-TOF MS was used to collect protein profiles of the bacteria to be tested,and the identification of microorganisms was achieved by comparing the characteristic peaks of the profiles.The 16 S rRNA gene sequencing was performed …查看全部>>

许一丹;谢成彬;苏喆;王频佳

成都医学院检验医学院临床微生物学教研室,四川成都 610500四川省妇幼保健院/成都医学院附属妇女儿童医院检验科,四川成都 610045四川省妇幼保健院/成都医学院附属妇女儿童医院检验科,四川成都 610045成都医学院检验医学院临床微生物学教研室,四川成都 610500

临床医学

细菌鉴定基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱16S rRNA序列全基因组测序

bacterial identificationMALDI-TOF MS16 S rRNA sequencewhole-genome sequen-cing

《检验医学与临床》 2024 (9)

1224-1228,1234,6

四川省大学生创新创业训练计划项目(S202013705085)成都医学院研究生创新基金项目(YCX2022-03-17)成都医学院检验医学院自然科学基金(JYZK202206)四川省妇幼保健院菁英人才科研启动项目(ZC6.16).

10.3969/j.issn.1672-9455.2024.09.008

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