河八王叶绿体基因组的结构特征与系统进化分析OA
河八王具有分蘖力强、抗倒伏、抗病能力强等优良性状,是甘蔗杂交育种的优良亲本.为了分析河八王在禾本科中的系统进化地位,采用第二代高通量测定技术对河八王的叶绿体基因组进行测序、组装和注释,分析其结构特征和系统进化关系.结果显示,河八王叶绿体基因组全长141218 bp,NCBI注册号为ON807673;具有2个反向重复序列IRA和IRB(22794 bp)、长单拷贝区(LSC,83095 bp)和短单拷贝区(SSC,12535 bp);具有103个蛋白质编码基因、8个rRNA和38个tRNA;具有114个SSR位点,三核苷酸重复类型最多,五核苷酸重复最少;系统进化表明,河八王与甘蔗属的甘蔗和甜根子草的亲缘关系最近.本研究结果为河八王种质鉴定和谱系地理分析提供了理论依据.
苗小荣;李娟云;黎东海;韩聪颖;牛俊奇
玉林师范学院生物与制药学院,广西玉林 537000玉林师范学院生物与制药学院,广西玉林 537000玉林师范学院生物与制药学院,广西玉林 537000玉林师范学院创新创业学院,广西玉林 537000玉林师范学院生物与制药学院,广西玉林 537000
河八王叶绿体基因SSR系统进化
《现代园艺》 2024 (11)
5-7,3
广西自然科学基金项目(2021GXNSFAA196061)广西大学生创新训练项目(S202310606154和202310606042)共同资助.
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