紫花苜蓿CAMTA基因家族鉴定及其在非生物胁迫下的表达模式分析OA北大核心CSTPCD
钙调蛋白结合转录激活因子(CAMTA)是一类重要的钙调素结合蛋白,在激素信号转导、发育调控和环境胁迫耐受中发挥着重要作用。本研究采用生物信息学技术,基于紫花苜蓿“新疆大叶”参考基因组,对紫花苜蓿中CAMTA家族成员进行鉴定,并对这些基因的理化性质、系统发育树、保守结构域、染色体上位置、顺式作用元件、转录表达谱进行分析和验证。结果表明,共鉴定出17个MsCAMTA基因,MsCAMTA家族成员可划分为3个亚家族,亚家族成员在基因结构、保守基序位置上较为相似。染色体定位结果显示,MsCAMTA家族成员不均匀地分布在7条染色体上。启动子区具有大量响应低温、盐胁迫及植物激素信号相关的顺式作用元件。此外,采用RT-qPCR对盐(300 mmol·L-1 NaCl)、模拟干旱(400 mmol·L-1甘露醇)、低温(10℃)和脱落酸(100μmol·L-1)处理下紫花苜蓿叶片中MsCAMTA1、MsCAMTA3、MsCAMTA11和MsCAMTA12的表达模式进行了初步研究。结果表明,4个MsCAMTA候选基因在各胁迫处理下均有一定程度的响应,且在盐胁迫下的表达量都呈上调趋势,表明MsCAMTA基因可能通过整合多种逆境应激信号,参与紫花苜蓿响应各非生物胁迫的应答过程。本研究结果将为进一步探索MsCAMTA基因在植物应对逆境胁迫中的功能提供参考。
孔海明;宋家兴;杨静;李倩;杨培志;曹玉曼;
西北农林科技大学草业与草原学院,陕西杨凌712100新疆农业大学草业学院,新疆乌鲁木齐830052
农业科学
紫花苜蓿CAMTA基因生物信息学分析基因表达
《草业学报》 2024 (005)
P.143-154 / 12
科技创新2030(2022ZD04011);国家现代农业产业技术体系(CARS-34);陕西省重点研发计划项目(2022ZDLNY01-07)资助。
评论