马家柚叶绿体基因组特征及其密码子偏好性分析OA北大核心CSTPCD
Analysis of the chloroplast genome sequence characteristics and its code usage bias of Citrus maxima(L.)Osbeck'Majiayou'
[目的]为了明确马家柚叶绿体基因组结构特征及其与同属类群的系统发育关系,阐明马家柚在柑橘属中的分类地位,对马家柚叶绿体基因组的特征及其密码子的偏好性进行分析.[方法]采用DNBSEQ-T7测序平台对马家柚进行测序,采用Noveplastys、CAP3、GeSeq和tRNAscan-SE软件对马家柚叶绿体基因组进行组装、注释;采用CGViewServer、MISA、REPuter、CodonW、Gview、IRscope、NADnaSP6.0 软件…查看全部>>
[Objective]Citrus maxima(L.)Osbeck'Majiayou'was approved by the former Ministry of Agriculture as a national geographical indication agricultural product in 2010.At present,all counties and cities in Shangrao City are vigorously developing the C.maxima(L.)Osbeck'Majiayou'industry.It is urgent to trace the origin of C.maxima(L.)Osbeck'Majiayou'to ensure its authenticity.There have been some studies indicating that the genetic relationship between C.maxima(L.)…查看全部>>
尹明华;余璐;周佳慧;刘李娜;徐文萱;孙美龄
上饶师范学院生命科学学院,上饶 334001||上饶农业技术创新研究院,上饶 334001||上饶师范学院马家柚产业研究院,上饶 334001||上饶市药食同源植物资源保护与利用重点实验室,上饶 334001||上饶市薯芋类作物种质保存与利用重点实验室,上饶 334001上饶师范学院生命科学学院,上饶 334001上饶师范学院生命科学学院,上饶 334001上饶师范学院生命科学学院,上饶 334001上饶师范学院生命科学学院,上饶 334001上饶师范学院生命科学学院,上饶 334001
园艺学与植物营养学
马家柚叶绿体基因组序列特征密码子偏好性最优密码子系统发育分析
Citrus maxima(L.)Osbeck'Majiayou'Chloroplast genomeSequence characteristicsCodon usage biasOptimal codonsPhylogenetic analysis
《果树学报》 2024 (5)
824-846,23
国家自然科学基金项目(31960079、31860084、32060092)江西省现代农业产业技术体系建设专项(JXARS-13-赣东站)2022年上饶市科技专项项目(饶科发[2023]5号社发类)(2022A008))江西省科技厅重点研发计划一般项目(20202BBG73010)江西省教育厅科学技术研究项目(GJJ201704、GJJ211729)上饶市科技局平台载体建设项目(2020J001)
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