基于高通量测序分析苗药血人参根和根瘤内生菌的多样性OA北大核心CSTPCD

目的:探究血人参根和根瘤内生细菌的组成差异,筛选优势内生菌菌株.方法:通过对16S rRNA基因进行高通量测序,对血人参根及根瘤中内生菌进行物种注释、分类、物种多样性和组间差异分析.结果:血人参根和根瘤内生菌总计含有5 574个OTU,隶属于30门79纲192目324科587属.根部的内生菌总计有5 518个OTU,在门分类水平上相对丰度较高的主要为变形菌门Proteobacteria、放线菌门Actinobacteriota,在属水平上相对丰度较高的为游动放线菌属Actinoplanes和norank_f_Kineosporiaceae属,其平均相对丰度分别为18.60％、10.05％;根瘤中内生菌总计有895个OTU,在门分类水平上相对丰度较高的为变形菌门Proteobacteria,在属水平上慢生根瘤菌属Bradyrhizobium占据绝对优势,其平均相对丰度为97.87％.血人参根瘤中内生菌的Shannon、ACE及Chao指数均显著低于根中(P＜0.05).根瘤内参与氨基酸的转运和代谢,细胞的复制、重组和修复,细胞的生物发生等功能菌群相对丰度较高.结论:血人参根瘤中内生菌以埃氏慢生根瘤菌和大豆慢生根瘤菌为主,且与根部相比,物种多样性水平低、群落结构更为单一、物种分布不均匀.