基于公共数据库的胶质瘤预后相关基因筛选OACSTPCD
Screening of key genes for prognosis of glioma based on public databases
目的:基于公共数据库筛选与胶质瘤临床预后相关的基因.方法:从高通量基因表达(GEO)数据库中获取编号为GSE31095的基因芯片数据,利用R包"limma"筛选差异表达基因,并对其进行基因本体论(GO)功能注释、京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析.通过String和Cytoscape构建蛋白质相互作用网络图,筛选出hub基因.采用癌症基因组图谱(TCGA)数据库和中国胶质瘤基因组图谱(CGGA)数据库验证hub基因,基于CGGA数据集m…查看全部>>
OBJECTIVE:Due to the high invasiveness and mortality of glioma,it is necessary to identify prognostic markers,such as glioma-associated hub genes,for improved treatment of this cancer.METHODS:Based on the Gene Expression Omnibus(GEO)database and limma R package,differentially expressed genes of glioma were downloaded,and oxidative stress-related genes based on the Genecard database.GSE31095 dataset(population from Netherlands and Sweden)was downloaded from t…查看全部>>
张艺;高含;郑展越;谭启涛;杨敏丽;孙艳
桂林医学院公共卫生学院,广西 桂林 541199桂林医学院公共卫生学院,广西 桂林 541199桂林医学院公共卫生学院,广西 桂林 541199桂林医学院公共卫生学院,广西 桂林 541199桂林医学院公共卫生学院,广西 桂林 541199桂林医学院公共卫生学院,广西 桂林 541199
临床医学
胶质瘤生物信息学关键基因预后
gliomabioinformaticshub geneprognosis
《癌变·畸变·突变》 2024 (3)
195-201,7
广西自然科学基金(2023GXNSFAA026035)
评论