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基于Nanopore测序技术的非洲猪瘟病毒全基因组测序方法建立OA北大核心CSTPCD

A Whole Genome Sequencing Method for African Swine Fever Virus based on Nanopore Sequencing Technology was Established

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非洲猪瘟(ASF)是由非洲猪瘟病毒(ASFV)引起的一种高度传染性和致死性疫病,近年来给我国生猪产业的健康发展造成了沉重打击.ASFV庞大的基因组导致人们难以及时掌握流行毒株的全基因组序列.本研究旨在利用Nanopore三代测序技术建立一种简便可靠的ASFV全基因组测序方法.设计覆盖ASFV全基因组的31对引物并分为4个引物池对样本进行扩增,通过Nanopore测序技术对扩增产物进行测序,进一步优化相关生物信息学分析方法,最终成功建立了ASFV全…查看全部>>

African swine fever(ASF)is a highly contagious and deadly disease caused by the African swine fever virus(ASFV),which has dealt a heavy blow to the healthy development of China's pig industry in recent years.The large genome of ASFV makes it difficult to obtain whole-genome sequence about epidemic strains in a timely manner.This study aims to establish a simple and reliable ASFV whole-genome sequencing method using Nanopore third-generation sequencing techno…查看全部>>

周扬;吴炜姿;曹伟胜;王福广;许秀琼;钟文霞;吴立炀;叶健;卢受昇

广东省动物疫病预防控制中心,广州 510230||华南农业大学兽医学院,广州 510642广东省动物疫病预防控制中心,广州 510230||华南农业大学兽医学院,广州 510642华南农业大学兽医学院,广州 510642广东省动物疫病预防控制中心,广州 510230广东省动物疫病预防控制中心,广州 510230广东省动物疫病预防控制中心,广州 510230广东省动物疫病预防控制中心,广州 510230广东省动物疫病预防控制中心,广州 510230广东省动物疫病预防控制中心,广州 510230

畜牧业

Nanopore测序非洲猪瘟病毒生物信息学分析

nanopore sequencingAfrican swine fever virusbioinformatics analysis

《畜牧兽医学报》 2024 (5)

2080-2089,10

10.11843/j.issn.0366-6964.2024.05.026

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