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基于环境RNA研究海山效应对浮游细菌多样性和分布的影响OA北大核心CSTPCD

中文摘要

研究采用环境RNA技术探究西太平洋M4海山区细菌多样性,并与基于环境DNA技术的研究结果进行比较,解析细菌代谢活性特征。结果表明基于环境RNA和DNA技术检获的物种构成相似,但真光层中蓝细菌在RNA中的占比明显高于DNA,显示其高代谢活性;而α变形菌在RNA中的占比明显小于DNA,代谢活性低;γ变形菌在RNA中占比更大且随水层加深而增加。物种间关系网络复杂度随着水深的增加呈先升高后下降的趋势。基于RNA数据构建的网络较DNA数据网络简单,且随着水深增加变化趋势更加显著,去除蓝细菌后网络变化剧烈,而去除α变形菌对网络影响小。综上,研究基于环境RNA技术提供了海山区浮游细菌多样性及分布更加完整的认知,α变形菌在海山区多样性占比和其在群落中作用可能被高估。

尹婷婷;赵峰;刘巍岳;徐奎栋;

青岛农业大学,青岛266109 中国科学院海洋研究所海洋生物分类与系统演化实验室,青岛266071青岛农业大学,青岛266109 中国科学院海洋研究所海洋生物分类与系统演化实验室,青岛266071 中国科学院大学,北京100049中国科学院海洋研究所海洋生物分类与系统演化实验室,青岛266071 中国科学院大学,北京100049

生物学

深海环境RNA细菌微生物多样性海山效应

《水生生物学报》 2024 (007)

P.1111-1119 / 9

国家自然科学基金(41930533和41976099);中国科学院青年创新促进会(2022206)资助。

10.7541/2024.2023.0338

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