抑郁症易感基因和抗抑郁药物靶点相关神经细胞类型及相互作用网络分析OACSTPCD
Identification of neuronal cell types and interaction network of susceptibility genes of depressive disorder and antidepressant drug targets
基于抑郁症的全基因组关联分析研究(GWAS),对于获得的单核苷酸多态性位点(SNP)使用Haploreg软件进行基因注释,得到SNP注释的102 个易感基因..使用MAGMA软件对GWAS的汇总统计数据做基因水平的分析,获得了270 个校正之后显著的基因,两者合并共得到 320 个抑郁症易感基因.通过药物数据库Drugbank获取 133 个抗抑郁药物靶点基因.使用EWCE包对抑郁症易感基因和抗抑郁药物靶点在三套脑组织单细胞测序数据中,分别进行神…查看全部>>
Our study is based on the genome-wide association analysis(GWAS)of depressive disorder,of which single nucleotide polymorphisms(SNPs)are retrieved and annotated by Haploreg software and 102 susceptibility genes are obtained by annotation of SNPs.Then gene-level analysis is performed on the summary statistics of GWAS by MAGMA software,and 270 significant genes are obtained after correction.Finally,a total of 320 susceptibility genes are obtained.Besides…查看全部>>
赵弘毅;丁伟健;冯飞翔;宋文正;刘书齐;高蕾
山东第一医科大学(山东省医学科学院) 生命科学学院 生物信息系,山东 泰安 271099山东第一医科大学(山东省医学科学院) 生命科学学院 生物信息系,山东 泰安 271099山东第一医科大学(山东省医学科学院) 生命科学学院 生物信息系,山东 泰安 271099山东第一医科大学(山东省医学科学院) 生命科学学院 生物信息系,山东 泰安 271099山东第一医科大学(山东省医学科学院) 生命科学学院 生物信息系,山东 泰安 271099山东第一医科大学(山东省医学科学院) 生命科学学院 生物信息系,山东 泰安 271099
生物学
单细胞测序抑郁症易感基因抗抑郁药物靶点,神经细胞相互作用网络
Single-cell RNA sequencingSusceptibility genes of depressive disorderAntidepressant drug targetsNeuronal cellInteraction network
《生物信息学》 2024 (2)
124-133,10
山东省大学生创新创业训练计划项目(No.S202010439097)山东省医药卫生科技发展计划项目(No.2019WS391)山东省自然科学基金项目(No.ZR2020MC061).
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