黄缘短头叶蝉线粒体基因组及系统发育分析OA北大核心CSTPCD
【目的】探究黄缘短头叶蝉(Iassus lateralis)的线粒体基因组结构及叶蝉亚科(Iassinae)的系统发育关系,为叶蝉的分类学、群体遗传学和进化学研究提供参考。【方法】通过高通量测序技术组装、拼接获得黄缘短头叶蝉线粒体基因组全序列,对其进行分析,并基于13个蛋白质编码基因(PCGs)和2个核糖体RNA基因(rRNAs)构建系统发育树。【结果】黄缘短头叶蝉线粒体基因组全长为15153 bp(GenBank登录号:OQ991898.2),由37个编码基因和1个控制区组成,37个编码基因包括13个PCGs、22个转运RNA基因(tRNAs)和2个rRNAs;碱基组成呈现明显的A+T偏向性;PCGs以ATN或TTG作为起始密码子,以TAA、TAG或T作为终止密码子;13个PCGs编码3624个氨基酸,其中,脯氨酸(Phe)的含量最多;22个tRNAs中,除trnS1缺失二氢尿嘧啶(DHU)臂外,其余均为典型的三叶草结构。系统发育分析表明,叶蝉亚科内的系统发育关系为:网脉叶蝉族(Krisinimi)单独聚为一支,短头叶蝉族(Iassini)、短板叶蝉族(Hyalojassini)和窄头叶蝉族(Batracomorphini)聚为一支。其中,黄缘短头叶蝉与褐盾短头叶蝉(I.dorsalis)聚为一支。【结论】叶蝉亚科内各族进化关系稳定,黄缘短头叶蝉的分类地位无较大变动,短板叶蝉族的分类地位需要用更多的样本数据进一步确定。
杨文欣;贺俊芳;田莉莉;王伟;李敏;张斌;
内蒙古师范大学生命科学与技术学院,内蒙古呼和浩特010022中国科学院成都生物研究所,四川成都610041太原师范学院生命科学与技术学院,山西晋中030619
生物学
黄缘短头叶蝉叶蝉亚科高通量测序线粒体基因组系统发育
《福建农林大学学报（自然科学版）》 2024 (004)
P.433-442 / 10
国家自然科学基金项目(32260122、31760632);内蒙古自然科学基金项目(2020MS03014);内蒙古自治区科技计划项目(2021GG0112);内蒙古师范大学基本科研业务费专项资金(2022JBXC016);内蒙古师范大学研究生科研创新基金项目(CXJJS22121)。
评论