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甲型流感病毒A/WSN/1933(H1N1)感染A549细胞的circRNA表达谱分析与鉴定OA北大核心CSTPCD

中文摘要

环状RNA(circRNA)已被证明在众多生物过程中起着重要的调控作用,而circRNA在甲型流感病毒(IAV)复制过程中的功能尚不清楚。本研究旨在利用高通量测序分析IAV感染A549细胞后的circRNA表达谱变化来挖掘能够影响病毒复制的circRNAs并对其进行初步功能鉴定。利用测序结果,对全部circRNAs进行特征分析、差异表达筛选;对差异circRNAs进行GO分析、KEGG分析;对候选circRNAs进行qPCR、RT-PCR验证及Sanger测序鉴定,并通过空斑试验确定影响病毒复制的circRNAs。结果:本试验共筛选到11 630条差异表达circRNAs,对其中6条circRNA进行了鉴定,最终确定novel_circ_007428具有抗病毒作用。本研究对甲型流感病毒感染A549细胞后的circRNA表达谱进行了分析与鉴定,为进一步研究circRNA在流感病毒感染中发挥的调控作用奠定了基础。

张晓婷;郑一青;曾亦然;常丽凤;陈纳;卢渊录;罗皓炜;高紫荷;平继辉;

南京农业大学动物医学院,江苏南京210095

畜牧业

环状RNA甲型流感病毒基因芯片测序A549表达谱novel_circ_007428

《畜牧与兽医》 2024 (007)

P.102-111 / 10

“十四五”国家重点研发计划(2021YFD1800205)。

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