基于个性化随机游走的基因-表型关联分析OA北大核心CSTPCD
Individual Random Walks for Gene-Phenotype Association Analysis
基因与表型间的关联分析对揭示生物的内在遗传关联具有重要意义.随机游走算法可以融合多组学数据,聚合一阶或高阶邻居的标签信息,对网络中不同节点间关联信息进行补全,提高关联预测的准确度,进而发现基因和表型间潜在的遗传关联.但现有随机游走算法通常平等地对待每个节点,忽略了不同节点的重要性,使非重要节点过度传播,降低了模型性能.为此,本文提出了一种基于多组学数据融合的个性化随机游走算法(indi-vidual Multiple Random Walks,i…查看全部>>
Association analysis between genes and phenotypes is crucial to reveal the inherent genetic association of organisms.Random walk-based algorithms can fuse multiple omics data,aggregate the label information of first-order or higher-order neighbors,complete the association information between different nodes in the network,improve the accuracy of association prediction and further discover the potential genetic associations between genes and phenotypes.Howeve…查看全部>>
谭好江;王峻;余国先;陈建;郭茂祖
山东大学软件学院,山东济南 250101||山东大学人工智能国际联合研究院,山东济南 250101山东大学人工智能国际联合研究院,山东济南 250101山东大学软件学院,山东济南 250101中国农业大学农学院,北京 100083北京建筑大学电气与信息工程学院,北京 100044
计算机与自动化
基因-表型关联随机游走异质网络多组学数据融合网络拓扑结构
gene-phenotype associationsrandom walkheterogeneous networkmulti-omics data fusionnetwork topology
《电子学报》 2024 (5)
1619-1632,14
国家自然科学基金(No.62031003,No.62072380)山东大学中央高校基本业务费(No.2020GN061) National Natural Science Foundation of China(No.62031003,No.62072380)Fundamental Re-search Funds of Shandong University(No.2020GN061)
评论