唐古特扁桃叶绿体基因组特征分析OA北大核心CSTPCD
Characterization of chloroplast genome extracted from Amygdalus tangutica
采用Illumina HiSeq X Ten平台测序和生物信息法对唐古特扁桃叶绿体基因组序列特征进行解析.结果表明:唐古特扁桃叶绿体基因组为四分体式结构,完整叶绿体基因组序列全长158 166 bp,G+C含量 36.8%,注释131个基因,即86个蛋白编码基因、8个rRNA基因和37个tRNA基因;其叶绿体基因组共有52 711个编码密码子,有33种类型是偏好密码子;唐古特扁桃叶绿体基因组中SSR位点有33个,串联重复有 13个;SSR中未检测…查看全部>>
Using the Illumina HiSeq X Ten sequencing platform and bioinformatics analysis methods,the sequence characteristics of the chloroplast genome of Amygdalus tangutica were analyzed in this study.The results showed that the whole chloroplast genome was a tetrad structure with 158 166 bp and G+C content of 36.8%.131 genes were annotated,including 86 protein coding genes,8 rRNA genes,and 37 tRNA genes.The protein coding genes encoded a total of 52 711 codons,of w…查看全部>>
段春燕;王晓凌
河南科技大学农学院,河南 洛阳 471023河南科技大学牡丹学院,河南 洛阳 471023
中医学
唐古特扁桃叶绿体基因组生物信息学密码子偏好性重复序列系统发育
Amygdalus tanguticacpDNA(chloroplast genome)bioinformaticscodon preferencerepeated sequencephylogeny
《湖南农业大学学报（自然科学版）》 2024 (3)
27-34,8
国家自然科学基金项目(U1304326)河南科技大学博士科研启动基金资助项目(4024-13480114)
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