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利用mtDNA COI、Cytb和D-loop条形码探讨地方牛的遗传多样性和系统发育关系OA北大核心CSTPCD

Exploring Genetic Diversity and Phylogenic Relationships of Indigenous Cattle using mtDNA COI,Cytb and D-loop Barcodes

中文摘要英文摘要

试验在不同地区采集皖南牛、雷琼牛、那曲牦牛和海子水牛血液和毛发样本,获得基因组DNA后,通过常规PCR技术扩增mtDNA COI、Cytb和D-loop基因,借助Sanger测序获得条形码序列,对地方牛品种的遗传多样性进行探究.结果表明:4种牛的线粒体基因中,A/T含量均显著高于G/C含量,具有明显的反G偏倚,且都表现出较高的遗传多样性,其中那曲牦牛表现尤为突出.COI和Cytb蛋白密码子的使用也表现出了一定的偏好性.基于Cytb基因构建的NJ系…查看全部>>

This study aimed to investigate the genetic diversity of local cattle breeds.In this experi-ment,blood and hair samples were collected in different regions from Wannan cattle,Leiqiong cattle,Naqu yak and Haizi buffalo,and genomic DNA was obtained.mtDNA COI,Cytb and D-loop genes were amplified by conventional PCR technique,and barcode sequences were obtained by Sanger sequencing,and then their genetic information was explored.The results showed that the A/T c…查看全部>>

张晓婷;彭珍珍;郭玛丽;袁朝海;蔡亚非;张威

南京农业大学动物科技学院,江苏南京 210095||南京农业大学动物科学类国家级实验教学示范中心,江苏南京 210095南京农业大学动物科技学院,江苏南京 210095||南京农业大学动物科学类国家级实验教学示范中心,江苏南京 210095南京农业大学动物科技学院,江苏南京 210095||南京农业大学动物科学类国家级实验教学示范中心,江苏南京 210095南京农业大学动物科技学院,江苏南京 210095||南京农业大学动物科学类国家级实验教学示范中心,江苏南京 210095南京农业大学动物科技学院,江苏南京 210095||南京农业大学动物科学类国家级实验教学示范中心,江苏南京 210095南京农业大学动物科技学院,江苏南京 210095||南京农业大学动物科学类国家级实验教学示范中心,江苏南京 210095

畜牧业

地方牛DNA条形码遗传多样性系统发育

indigenous cattle breedDNA barcodegenetic diversityphylogeny

《家畜生态学报》 2024 (8)

8-15,8

国家重点研发计划(2018YFC1200201)江苏省自然科学基金(BK20160722)国家自然科学基金(31701229)中央高校基本业务费(KYZ201723、KJQN201829)

10.3969/j.issn.1673-1182.2024.08.002

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