基于参考的基因序列压缩算法综述OA
【背景】在过去的二十年里,DNA测序技术持续发展,海量生物序列数据的产生给数据存储、管理和传输带来了严峻的挑战。【目的】本文主要总结近十五年基于参考的基因序列压缩算法,以寻求加速生物数据共享和降低存储成本的方法。【方法】本文从算法的发展角度出发,按照不同算法所使用的关键技术和针对压缩优化的方案进行分类。通过实验验证当前主流算法的性能,揭示当前基于参考的压缩算法所存在的问题。提出一些值得探讨的研究方向,并对未来的研究方向进行了展望。【结果】本文分析…查看全部>>
蔡佳威;胡川;王华进;沈志宏
中国科学院计算机网络信息中心,北京100083 中国科学院大学,北京100049中国科学院计算机网络信息中心,北京100083 中国科学院大学,北京100049中国科学院计算机网络信息中心,北京100083 中国科学院大学,北京100049中国科学院计算机网络信息中心,北京100083 中国科学院大学,北京100049
生物工程
参考序列基因压缩DNA序列
《数据与计算发展前沿（中英文）》》 2024 (4)
P.59-76,18
国家重点研发计划项目“面向国家科学数据中心的基础软件栈及系统”(2021YFF0704200)中国科学院“十四五”网信专项工程建设项目“科学大数据工程(三期)”(CAS-WX2022GC-02)。
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