硒都黑猪NT5C1A基因核心启动子区鉴定及转录因子预测OA北大核心CSTPCD
本研究旨在探究猪胞质 5'核苷酸酶 1A基因(Cytosolic 5'-Nucleotidase1A,NT5C1A)启动子区序列的结构特性,确定其核心启动子区并分析其关键转录因子结合位点,为探究其表达调控机制提供理论依据.对NT5C1A互作蛋白进行预测,在线生物信息学分析软件预测猪NT5C1A基因核心启动子区,根据预测结果设计 7 对启动子缺失片段引物,以硒都黑猪血液基因组DNA为模板,通过PCR扩增和Sanger测序方法获得NT5C1A基因 5'端 7 个启动子缺失片段并克隆至pGL3-Basic载体,以双荧光素酶报告基因检测试验对缺失片段进行荧光素酶活性检测,并通过转录因子在线预测软件预测核心启动子区潜在的转录因子.结果表明,NT5C1A基因核心启动子位于转录起始位点-290～+109 bp的位置(ATG作为+1),该区域含有MYOD1、MYOG、MYF5 和SP1 等肌肉发育相关的转录因子结合位点.本试验为研究NT5C1A基因调控猪肌肉发育的分子机制提供了理论依据.
任双;吴俊静;彭先文;张志红;周佳伟;梅书棋;乔木;杜志强
长江大学动物科学技术学院,湖北荆州 434020||湖北省农业科学院畜牧兽医研究所,动物胚胎工程及分子育种湖北省重点实验室,湖北武汉 430064湖北省农业科学院畜牧兽医研究所,动物胚胎工程及分子育种湖北省重点实验室,湖北武汉 430064江夏区农业农村局农业行政执法大队,湖北武汉 430023长江大学动物科学技术学院,湖北荆州 434020
畜牧业
硒都黑猪NT5C1A核心启动子区转录因子生物信息学
《中国畜牧杂志》 2024 (008)
116-121,128 / 7
湖北省自然科学基金杰出青年项目(2023AFA091);国家重点研发计划项目(2021YFD1301101);国家生猪产业技术体系项目(CARS-35);湖北洪山实验室重大项目(2021hszd003)
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