基于生物信息学分析的结直肠癌关键基因筛选OA
Identification of Key Genes in Colorectal Cancer Based on Bioinformatics
目的:筛选结直肠癌发生发展中的关键基因,并分析其与生存预后和肿瘤免疫浸润的关系.方法:从GEO数据库下载结直肠癌基因表达谱GSE178145.用R软件筛选结直肠癌组织与正常组织样本间的差异表达基因(DEGs),通过基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析这些基因以确定它们的生物学作用.构建蛋白相互作用网络(PPI)鉴定结直肠癌进展的关键基因,然后通过GEPIA2 数据库验证其表达水平及生存预后情况.最后利用TIMER数据库分析预…查看全部>>
Objective To screen key genes in the occurrence and development of colorectal cancer and analyze their relation-ship with survival prognosis and immune infiltration.Methods The gene expression profile of colorectal cancer GSE178145 was downloaded from Gene Expression Omnibus(GEO).Differentially expressed genes(DEGs)between colorectal cancer and normal tissues were screened using R software.The biological effects of these genes were determined by gene ontolog…查看全部>>
李珂云;彭昇;曹镐禄;曾涵仪;石圣成;陈水亲;万绍贵;李珍妮;张文娟
赣南医科大学基础医学院,江西 赣州 341000||赣南医科大学心脑血管疾病防治教育部重点实验室,江西 赣州 341000赣南医科大学基础医学院,江西 赣州 341000赣南医科大学基础医学院,江西 赣州 341000赣南医科大学基础医学院,江西 赣州 341000赣南医科大学第一临床医院,江西 赣州 341000赣南医科大学基础医学院,江西 赣州 341000赣南医科大学基础医学院分子病理学中心,江西 赣州 341000赣南医科大学第一临床医院,江西 赣州 341000赣南医科大学基础医学院,江西 赣州 341000||赣南医科大学心脑血管疾病防治教育部重点实验室,江西 赣州 341000
结直肠肿瘤生物信息学预后肿瘤浸润
Colorectal cancerBioinformaticsPrognosisTumor infiltration
《湖北医药学院学报》 2024 (4)
390-395,400,7
国家自然科学基金(82360404)江西省自然科学基金项目(20232BAB206127)江西省教育科学技术研究项目(GJJ2201410)江西省大学生创新创业训练计划项目校级项目(X202410413003)
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