金黄色葡萄球菌型乳房炎奶牛乳腺组织的lncRNA差异表达分析OA北大核心CSTPCD

【目的】长链非编码RNA(lncRNA)可参与机体炎症反应,但其在奶牛乳房炎中的表达模式及分子调控机制仍不完全清楚。分析金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus,S.aureus)型乳房炎奶牛乳腺组织中的差异表达lncRNA(DElncRNA)及其功能,为后续深入研究提供支撑。【方法】利用转录组测序(RNA-Seq)技术和生物信息学方法对健康奶牛和S.aureus诱导乳房炎的奶牛乳腺组织进行lncRNA测序、DElncRNA分析及GO和KEGG功能富集分析。【结果】在两组乳腺组织中共检测到1012个lncRNA。相比于健康奶牛组,S.aureus诱导组筛选到75个表达上调的和114个表达下调的lncRNA。GO和KEGG富集分析结果表明,上述DElncRNA可通过免疫相关信号通路而调节奶牛乳房炎症。进一步分析发现,DElncRNA TCONS_00042123、TCONS_00068055、TCONS_00108420和TCONS_00076361可能参与MAPK、NLR、Jak-STAT和TLR信号通路,进而调节S.aureus型奶牛乳房炎的发生与发展。【结论】在S.aureus诱导炎症的奶牛乳腺组织中获得了189个DElncRNA,可能通过潜在靶基因调控S.aureus型奶牛乳房炎的发生与发展过程。