基于全基因组InDel分析我国细鳞鲑遗传分化及本地适应性OA北大核心CSTPCD
为了从全基因组InDel角度进行全国地理尺度细鳞鲑属遗传分化与适应性研究,文章对采自陕西、甘肃、新疆、河北和黑龙江的6个细鳞鲑群体(共90尾样本)进行建库测序及InDel检测分析。结果表明:6个细鳞鲑群体共检测到3056034个高质量InDel突变位点,缺失位点数大于插入位点数,将各基因区域标准化后观察到内含子区富集到相对更多的InDel位点。所有系统发育树分支中共统计到1715464个固定的InDel,占总数的56.08%,且主要位于每个谱系的…查看全部>>
张鑫淼;赵春龙;谢鹏;冯广朋;陈朋;王立新;熊冬梅
西北农林科技大学动物科技学院水产科学系,杨凌712100河北省海洋与水产科学研究院,秦皇岛066200华中农业大学水产学院,武汉430070中国水产科学研究院东海水产研究所,上海200090新疆维吾尔自治区水产科学研究所,乌鲁木齐830000西北农林科技大学动物科技学院水产科学系,杨凌712100西北农林科技大学动物科技学院水产科学系,杨凌712100
生物学
InDel全基因组重测序种群结构本地适应细鳞鲑
《水生生物学报》 2024 (10)
P.1724-1735,12
国家自然科学基金(32273138)中央高校基本科研业务费(2452020154)资助。
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