猪ISG 20基因生物信息学分析及其抗PEDV感染的初步研究OA北大核心CSTPCD
为了研究猪干扰素刺激基因20(interferon-stimulated gene 20,ISG20)的序列信息及其表达情况,并探讨其对猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)增殖的影响,以提取的猪小肠上皮细胞IPEC-J2总RNA为模板扩增猪ISG 20基因的CDS区序列,并应用生物信息学进行分析,进而构建pcDNA3.1-3×Flag-ISG20重组质粒转染入IPEC-J2细胞鉴定表达情况。此外,在转染重组质粒的细胞中感染PEDV分析ISG20对PEDV增殖的影响。结果表明,猪ISG 20基因CDS区的大小为516 bp,编码171个氨基酸,理论等电点(pI)为8.84;猪ISG20存在2个N-糖基化位点和23个磷酸化位点,主要定位于细胞骨架和细胞质中,以α-螺旋和无规则卷曲构成;构建的pcDNA3.1-3×Flag-ISG20重组质粒能够在IPEC-J2细胞中表达,蛋白大小约为19.6 ku,而且可以明显抑制PEDV的增殖;克隆了猪ISG 20基因,并且在IPEC-J2细胞中重组质粒pcDNA3.1-3×Flag-ISG20能够表达且发挥抑制PEDV增殖的作用,研究结果为深入探讨PEDV与ISG20的相互作用,以及以此为靶点筛选抗PEDV生物制剂提供了思路。
王梦璐;张志杰;李之晗;聂晶晶;瞿云芝;张春红;刘志成;沈海燕;张建峰;孙亚妮;李玉谷;
华南农业大学兽医学院,广东广州510642 广东省农业科学院动物卫生研究所/广东省畜禽疫病防治研究重点实验室,广东广州510640西北农林科技大学动物医学院,陕西杨陵712100 广东省农业科学院动物卫生研究所/广东省畜禽疫病防治研究重点实验室,广东广州510640广东省农业科学院动物卫生研究所/广东省畜禽疫病防治研究重点实验室,广东广州510640 岭南现代农业科学与技术广东省实验室茂名分中心,广东茂名525032西北农林科技大学动物医学院,陕西杨陵712100华南农业大学兽医学院,广东广州510642
畜牧业
干扰素刺激基因20生物信息学分析真核表达猪流行性腹泻病毒
《动物医学进展》 2024 (010)
P.7-14 / 8
猪禽种业全国重点实验室项目(2023QZ-NK13,ZQQZ-55);广东省农业农村厅"十四五"广东省农业科技创新十大主攻方向"揭榜挂帅"项目(2022SDZG02);广东省科学技术厅基础研究基金项目(2021A1515011125,2023A1515011681);广东省科学技术厅畜禽疫病防治研究重点实验室项目(2023B1212060040);岭南现代农业科学与技术广东省实验室茂名分中心自主科研项目(2022KF010);国家自然科学基金项目(31302101)。
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