一株猪源optrA阳性屎肠球菌的分离鉴定及基因组特征分析OA

为了调查湖南浏阳地区某生猪养殖场屎肠球菌的耐药情况及耐药基因可能存在的传播机制,从浏阳地区某猪场中采集不同生长阶段猪只肛拭子以及环境样本共345份,从中分离鉴定出76株肠球菌,其中屎肠球菌1株(1.3%),采用琼脂扩散法考察屎肠球菌对10种抗菌药物的耐药情况,并对该菌株进行全基因组测序,检测其耐药基因和毒力基因的分布情况,最后对optrA特定基因组结构进行分析。结果显示,从猪只肛拭子样本分离的编号Ec63菌株,经全基因组测序组装、拼接,得到一条大小为2759403 bp的环状DNA(GC含量为37.9%),携带9大类抗菌药的10种耐药基因,均定位于染色体上,其中氨基糖苷类耐药基因数量最多,且携带有噁唑烷酮类耐药基因optrA;此外,该菌株携带sagA等毒力基因21个,不含有强毒菌株的毒力基因序列。药物敏感性试验结果表明,该菌株对头孢噻呋、四环素呈现高度耐药,对恩诺沙星、万古霉素、红霉素、庆大霉素、头孢西丁、氟苯尼考、利奈唑胺和甲氧苄啶/磺胺甲噁唑敏感。特定基因组结构分析显示,该菌株存在fexA-optrA核心遗传环境。结果表明,该菌株对机体表现弱毒力的潜力,但存在多耐药性(MDR)基因,是一株多重耐药屎肠球菌。fexA-optrA的基因遗传环境在屎肠球菌耐药传播中起着重要作用,对公共卫生安全具有潜在威胁。本研究结果可为屎肠球菌在养殖业中的应用提供参考依据。