基于宏基因组学技术揭示祁连地区藏羊胃肠道菌群的多样性OACSTPCD

为研究高寒地区藏羊胃肠道菌群的特点,利用宏基因组测序技术分析青海省祁连县藏羊胃肠道微生物的组成及其多样性,对该地区藏羊肠道菌群进行了细菌多样性、丰度及功能注释的检测。结果表明:在古生菌门水平上QL地区藏羊胃肠道的优势菌门为Euryarchaeota,在属水平的优势菌属为Methanobrevibacter;在细菌门水平上,QL地区藏羊瘤胃的优势菌门为Bacteroidetes,而肠道的优势菌门均为Firmicutes,属水平上,QL地区藏羊瘤胃的优势菌属为Prevotella,回肠优势菌属为Clostridium,盲肠优势菌属为Bacteroides;在真菌门水平上,QL地区藏羊胃肠道的优势菌门为Ascomycota,在属水平上瘤胃的优势菌属为Mucor,回肠优势菌属为Paraphaeosphaeria,盲肠优势菌属为Colletotrichum。在CAZyme、eggNOG、KEGG分析中,发现肠道微生物代谢功能富集主要在糖苷水解酶、碳水化合物运输与代谢、氨基酸运输与代谢、核苷酸代谢等;在CARD的抗性基因分析中,QL藏羊胃肠道在Bifidobacterium注释到的基因丰度最多,其次为Nocardia、MexF。上述结果将为进一步研究高海拔高寒地区反刍动物肠道微生物的作用机理奠定基础。