北京黑猪全基因组ROH检测和选择信号分析OA北大核心CSTPCD
旨在基于长纯合片段(ROH)和选择信号iHS分析北京黑猪群体的遗传结构,挖掘与经济性状相关的候选基因。本研究的对象为北京黑猪群体,平均日龄为210 d。对729头北京黑猪的illumina Porcine 50K芯片数据进行质控和填充后,进行ROH和iHS的分析。本研究选择参与组成ROHs的前1%的SNPs作为ROH岛的阈值,将超过此阈值的区域称为ROH岛。保留标准化的iHS值中排在前1%的所有SNPs位点,将位点上下游各延伸200 kb作为选择…查看全部>>
田晶晶;王晓庆;李棉燕;王海玲;吴启钿;王立贤;张龙超;赵福平
中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,北京100193中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,北京100193中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,北京100193中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,北京100193中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,北京100193中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,北京100193中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,北京100193中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,北京100193
畜牧业
北京黑猪芯片数据ROHiHS
《畜牧兽医学报》 2024 (9)
P.3833-3842,10
国家重点研发计划(2021YFD1301101)中国农业科学院科技创新工程(ASTIP-IAS02)国家生猪产业技术体系(CARS-35)。
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