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基于全基因组重测序解析豁眼鹅SNP标记特征OA北大核心CSTPCD

中文摘要

本研究选用成年豁眼鹅母鹅 10 只,采用全基因组重测序方法进行SNP变异检测,使用群体内选择信号分析方法,筛选豁眼鹅受到选择的区域.针对受选择基因进行富集分析,挖掘与豁眼鹅耐寒适应性、高产蛋性能等种质特性相关的候选基因.结果表明,样本平均测序深度为 10.83X,平均比对率为 98.37%,平均注释SNP总数为3 331 076个,其中基因内突变有16 622个(非同义突变16 103个,可变剪切位点突变有182个,终止密码子突变平均有 337 …查看全部>>

赵洪昌;高广亮;王健;孙国波;穆晓恵;王军;赵孟丽;李晓鸣;张干生;纪荣超;陈超

江苏农牧科技职业学院,江苏泰州 225300||国家水禽基因库,江苏泰州 225511重庆市畜牧科学院,重庆 402460江苏农牧科技职业学院,江苏泰州 225300||国家水禽基因库,江苏泰州 225511||泰州丰达农牧科技有限公司,江苏泰州 225511江苏农牧科技职业学院,江苏泰州 225300||国家水禽基因库,江苏泰州 225511江苏农牧科技职业学院,江苏泰州 225300||国家水禽基因库,江苏泰州 225511江苏农牧科技职业学院,江苏泰州 225300||国家水禽基因库,江苏泰州 225511江苏农牧科技职业学院,江苏泰州 225300||国家水禽基因库,江苏泰州 225511江苏农牧科技职业学院,江苏泰州 225300||国家水禽基因库,江苏泰州 225511江苏农牧科技职业学院,江苏泰州 225300||国家水禽基因库,江苏泰州 225511||泰州丰达农牧科技有限公司,江苏泰州 225511国家水禽基因库,江苏泰州 225511||泰州丰达农牧科技有限公司,江苏泰州 225511国家水禽基因库,江苏泰州 225511||泰州丰达农牧科技有限公司,江苏泰州 225511

畜牧业

豁眼鹅重测序SNPiHS种质特性

《中国畜牧杂志》 2024 (9)

146-152,7

江苏省种业振兴揭榜挂帅项目(JBGS[2021]030)江苏省科技计划专项资金(BE2022359)校级科研项目(NSF2022CB18)

10.19556/j.0258-7033.20221229-02

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